当前解析结果
SmilChr03G004011| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004011 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004011 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G004011 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 59101317 - 59104691 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131014869 |
|---|---|
| GeneID | 131014869 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131014869 |
| 原始查询 | LOC131014869 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131014869 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057798984.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057798985.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057798984.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057798984.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057798984.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:59103138 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr3:59103149 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,B85 |
Chr3:59103161 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B117,B132,B37,B63,B89,C34,C8,C87 |
Chr3:59103166 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr3:59103197 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr3:59103211 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C71,D9 |
Chr3:59103216 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B57,C72 |
Chr3:59103297 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C83 |
Chr3:59103298 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr3:59103387 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,B85 |
Chr3:59103398 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr3:59103403 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A25,B128,B9,B90,B92,C25,C49,C60,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。