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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004013`

染色体: Chr03 坐标: 59110313-59117235 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004013`
名称	SmilChr03G004013
描述	uncharacterized SmilChr03G004013
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59110313 - 59117235 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014870`
GeneID	`131014870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014870`
原始查询	`LOC131014870`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824390]; symbol=AT3G52250; hit=AT3G52250; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824390]; symbol=AT3G52250; hit=AT3G52250; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G52250` (AT3G52250) Duplicated homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824390] identity=37.3; qcov=0.557; evalue=6.05e-133; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057798987.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798987.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798987.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057798987.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057798987.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59110522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B97,C33,C82,D10
`Chr3:59110573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:59110633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C45,D6
`Chr3:59110655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B139
`Chr3:59110664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B91
`Chr3:59110758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,D10
`Chr3:59110782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D10
`Chr3:59110825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B97,C33,C82
`Chr3:59110908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B71,C62
`Chr3:59110921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C77,D6
`Chr3:59110923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D6
`Chr3:59110970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798987.1

1614 aa

807

1614

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 776-819 aa PF00249 Myb_DNA-binding 994-1035 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798987.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	776	819	1.6e-15	57.6	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057798987.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	994	1035	1.6e-15	57.6	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943004.1
AAAACAGGAACTTAAAGCGCAATGAAAGCCAAGAAAAAAGAAAGAAAAAGGAAGAAGTCTTCTCTCTCTCATCCTCACACACACTCTCTCTCATTTTTGTCCCTTATCACCTCACACACACTACTTCTCACAAAAATTTCCTTACCTCTTCCCCGCCCCCCAAATCTGCAACAAAAGAAGGAAAAAGGGTTAAATTTACCGCTCACATATTCACAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGGCTTGCTTGAAATCACAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014870
ATGCCGCCGGAGCCATTGCCTTGGGATCGAAGGGATTTCCGGAAGCACGACAGATCCGCTTCTAACGCCCGCGCCGTCGCCGGAGGATTGGGCCGCGGCGGGCCCCCAAAATGGCGGGACCAGCAGCAGCAGCAGCGCCACCACCGCGCTCCGCCTCCATATCACCCGCAGCAGCGGTGGTATTCTGATTTCCGCTCCCCTGGCCAGAGCAAGCAGGGTGGTTGGCCTATGTATTCTGGTGATGCTGGTCAAGGGTTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798987.1
MPPEPLPWDRRDFRKHDRSASNARAVAGGLGRGGPPKWRDQQQQQRHHRAPPPYHPQQRWYSDFRSPGQSKQGGWPMYSGDAGQGFMPFGSRCDRNLEDEDCQPFGSRGNGRHFRTDRGSFTRKDWKGPSWEAAAVHNSTGETITEVNKLRSIENTQPCHNRSSRSDCASHAPLGSISLSDQSQTESLSREKNDNTTDETTGKGEESEKENCLEPVEWKPLKWSRVGSLSSRSSCTSHPTSSKSPGRDSIEVLLEVKPKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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