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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004048`

染色体: Chr03 坐标: 59448621-59454217 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004048`
名称	SmilChr03G004048
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59448621 - 59454217 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014878`
GeneID	`131014878`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014878`
原始查询	`LOC131014878`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=26.2; qcov=0.985; evalue=3.27e-65; confidence=low
Rice	`Os09g0479500` - identity=27.8; qcov=0.829; evalue=1.37e-75; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014878

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057798997.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057798997.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057798997.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057798997.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057798997.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59451479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:59451647`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	109	A1,A11,A14,A2,A20,A22,A24,A25,A4,A6,A7,B10,B101,B102,B106,B107,B108,B109,B112,B113,B119,B12,B128,B129,B130,B131,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B20,B22,B26,B28,B30,B31,B33,B34,B40,B43,B46,B47,B48,B52,B55,B57,B6,B60,B63,B66,B67,B7,B70,B74,B75,B76,B86,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,C12,C15,C17,C18,C2,C21,C23,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C34,C35,C40,C42,C44,C47,C49,C51,C53,C55,C61,C63,C67,C68,C71,C72,C73,C78,C79,C80,C81,C9,D1,D11,D3,D8,D9
`Chr3:59451651`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	108	A1,A11,A2,A20,A22,A24,A25,A4,A6,A7,B10,B101,B102,B106,B107,B108,B109,B112,B113,B119,B12,B128,B129,B130,B131,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B20,B26,B28,B30,B31,B33,B34,B40,B43,B46,B47,B48,B52,B55,B57,B6,B60,B63,B66,B67,B7,B70,B74,B75,B76,B86,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,C12,C15,C17,C18,C2,C21,C23,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C34,C35,C40,C42,C44,C47,C49,C5,C51,C53,C55,C61,C63,C67,C68,C71,C72,C73,C78,C79,C80,C81,C9,D1,D11,D3,D8,D9
`Chr3:59451702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B127,B134,B34
`Chr3:59451721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A13,A4,B112,B121,B127,B16,B25,B30,B51,B68,B72,B83,B94,B98,C20,C23,C37,C42,C55,C83,C87,D6
`Chr3:59451777`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	63	A1,A14,A2,A20,A22,A24,B101,B102,B106,B107,B109,B112,B113,B12,B128,B129,B130,B131,B14,B25,B30,B33,B46,B47,B52,B55,B6,B60,B67,B70,B74,B75,B86,B9,B90,B92,B95,B98,C12,C19,C21,C23,C31,C32,C35,C39,C40,C42,C49,C53,C61,C63,C68,C71,C78,C79,C81,C9,D1,D3,D6,D8,D9
`Chr3:59451784`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	63	A1,A14,A2,A20,A22,A24,B101,B102,B106,B107,B109,B112,B113,B12,B128,B129,B130,B131,B14,B25,B30,B33,B46,B47,B52,B55,B6,B60,B67,B70,B74,B75,B86,B9,B90,B92,B95,B98,C12,C19,C21,C23,C31,C32,C35,C39,C40,C42,C49,C53,C61,C63,C68,C71,C78,C79,C81,C9,D1,D3,D6,D8,D9
`Chr3:59451826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,A24
`Chr3:59451846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C48,C82
`Chr3:59451850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr3:59451913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr3:59451919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057798997.1

894 aa

447

894

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 142-329 aa PF23559 WHD_DRP 408-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057798997.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	142	329	7.3e-39	133.8	NB-ARC domain
`XP_057798997.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	408	481	8.8e-20	71.2	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

25 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098365.1
TATTAAATTTTCAACGATTCACAAAGTAAGTCAATCCTCTCTCTCTTTACCACACACAAAATTTAAGAGCAGAGCTCGGCGATCGTATGGCAGCTTATGCCGCTCTTGCTTCCCTTTCTCAAACTACACATCTTACTATCAATAAACACAAATCTCACTTTTCCATCGTTGCGGAAGAAAAAATTAGATCCATCCATGAGTATGTCATTTTCTTGCTATCTTTCCTCCAAGATTTTCCACAGAAATCCAAGCGTTGGGAA...

XR_009098355.1
ATTAAATTTTCAACGATTCACAAAGTAAGTCAATCCTCTCTCTCTTTACCACACACAAAATTTAAGAGCAGAGCTCGGCGATCGTATGGCAGCTTATGCCGCTCTTGCTTCCCTTTCTCAAACTACACATCTTACTATCAATAAACACAAATCTCACTTTTCCATCGTTGCGGAAGAAAAAATTAGATCCATCCATGAGTATGTCATTTTCTTGCTATCTTTCCTCCAAGATTTTCCACAGAAATCCAAGCGTTGGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014878
ATGGCAGCTTATGCCGCTCTTGCTTCCCTTTCTCAAACTACACATCTTACTATCAATAAACACAAATCTCACTTTTCCATCGTTGCGGAAGAAAAAATTAGATCCATCCATGAGTATGTCATTTTCTTGCTATCTTTCCTCCAAGATTTTCCACAGAAATCCAAGCGTTGGGAAGTCAAGATGAGGGATGTAGCTCATGAAGCTGAAGATATTATCAAACAATACATCTCCCAGCTGTCATATAATAGATGGATTAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057798997.1
MAAYAALASLSQTTHLTINKHKSHFSIVAEEKIRSIHEYVIFLLSFLQDFPQKSKRWEVKMRDVAHEAEDIIKQYISQLSYNRWIRPSNVKFEDQLSNVSQKLCLMAGDLIDDGPAHSRLAVSSSSRVASTGNSAVVGLDEDLMAIKDRLCGYPSKLQVIPIVGMGGIGKTTLARNVYDDLLTVEHFHIRVWLTVSQDYNAQKVLLDVLHSINLFEQRMCLGVEDSMVLREEQMHREETDDSTIAETVYKKLKGRRYLIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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