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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004030`

染色体: Chr03 坐标: 59315853-59320293 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004030`
名称	SmilChr03G004030
描述	uncharacterized SmilChr03G004030
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59315853 - 59320293 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014896`
GeneID	`131014896`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014896`
原始查询	`LOC131014896`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT transposon superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820488]; symbol=AT3G13020; hit=AT3G13020; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hAT transposon superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820488]; symbol=AT3G13020; hit=AT3G13020; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G13020` (AT3G13020) hAT transposon superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820488] identity=36.6; qcov=0.914; evalue=4.44e-119; confidence=medium
Rice	`Os03g0822900` - identity=32.4; qcov=0.872; evalue=2.03e-97; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF04937 (DUF659); PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014896

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799026.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799026.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799026.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799026.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59317628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B58,C18
`Chr3:59317818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:59317831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B22
`Chr3:59317863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr3:59317864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:59317983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B83,C25
`Chr3:59317991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B56,B6,B96,C67
`Chr3:59318062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B72,C25
`Chr3:59318073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B63,C25,C9
`Chr3:59318084`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C25
`Chr3:59318084`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C25
`Chr3:59318085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799026.1

594 aa

297

594

DUF659

Dimer_Tnp_hAT

PF04937 DUF659 97-249 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 467-538 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799026.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	97	249	4.1e-53	179.7	Domain of unknown function (DUF659)
`XP_057799026.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	467	538	1.6e-05	25.3	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943043.1
ATTCCAGAAACAGAAACACAGAAAATCAACACTTTAAAACAAAACAAAAAGAAGAGATTGGTACATGGCCTGAAAGTGTGAAAGTGAAATTCCTTTCGAGCAGACCACAATCCCCACCGCTGCGCGTCGCTTTGGGGTATCTCTGGCCCCATTTTCTCTCTCTATAAGTCTCACCTAATCCCATCTCCCTTTCCTCACTCATTCAGTTGAAAGCAAGAAGAACTGCATGCAAAGGGTGAACTAAGTGGTCGAGAAGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014896
ATGGATACAACAGGGCGTATTGTGAGACACGGAGCCGTTGATGAGAGGCGATATAGAAGTGCATCATCAGAAAACAACGGGGTGGCATCAACTTCTTGCCAGGGCAGGGAGACATTGGAATGTCCTCATATCTCTCCCACCACCGCTGCTGAGGCTTTGGTAAAGGAAGCGAAGATGCACATCGGTAGATTCTTTTATGAGAATGGATTGGATTTCGATGCTGTCAATTCTCCGAGCTTCCAGAGCATGATCTCCCTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799026.1
MDTTGRIVRHGAVDERRYRSASSENNGVASTSCQGRETLECPHISPTTAAEALVKEAKMHIGRFFYENGLDFDAVNSPSFQSMISLFCRRGMQCQAPTVEELKGWIFEDVIKEMNQRVDEIRRSWAETGCTIMLDGWTDANGRSLVNVLVDCPKGTVYLHSSDISDCLKNMDAMQTFFAKILAEVGVQNVVQIMTYSSSAFMKEAGTQLMERYRPIFWTVSASHCIELMLEKLGSMDLIKQTLEKAKIITRFVHSNPIAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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