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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004082`

染色体: Chr03 坐标: 59746806-59749983 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004082`
名称	SmilChr03G004082
描述	uncharacterized SmilChr03G004082
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59746806 - 59749983 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014921`
GeneID	`131014921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014921`
原始查询	`LOC131014921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	initiation factor 4F subunit (DUF1350) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823446]; symbol=AT3G43540; hit=AT3G43540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	initiation factor 4F subunit (DUF1350) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823446]; symbol=AT3G43540; hit=AT3G43540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G43540` (AT3G43540) initiation factor 4F subunit (DUF1350) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823446] identity=64.6; qcov=0.846; evalue=7.33e-160; confidence=high
Rice	`Os09g0436900` - identity=68.9; qcov=0.332; evalue=1.11e-60; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07082 (DUF1350)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799077.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057799077.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057799077.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057799077.1`
5	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057799077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59746986`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A25,B20,B5,B87,C21,C70
`Chr3:59747295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B74,C42,C60
`Chr3:59747321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:59747341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B8,C33
`Chr3:59747352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B105,C13,C38
`Chr3:59747353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B50,B64,C32,C40,C68
`Chr3:59747515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:59747779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,C11,C46,C69,C74
`Chr3:59747787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:59747805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr3:59748402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,C11,C46,C69,C74
`Chr3:59749386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B74,C42,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799077.1

397 aa

198

397

DUF1350

PF07082 DUF1350 76-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799077.1`	Pfam	`PF07082`	DUF1350	Family	76	391	1e-46	160.0	Protein of unknown function (DUF1350)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943094.1
ATGGCGGCCGCCATTCTCGCCTGCAATAACTTCCCCCAACTCAAACTCCATTTATCATCTCCCTCTCATTTCATCGCTCGCGCTTCTCGCTTCCGTGGGAAACCCAATTTCTCGTCCTTGCCGCACATGACGATCAACGGCATCTCAAATTCCCAATACGGTAGGGCATCCGAAGGTTCTGGAAGCTTCGGGTACGGAGGCGGTAAGATTTACCGGCGGCTCGGCTCTTGTCTGGTGATACCTCCGACGAAAGGCAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014921
ATGGCGGCCGCCATTCTCGCCTGCAATAACTTCCCCCAACTCAAACTCCATTTATCATCTCCCTCTCATTTCATCGCTCGCGCTTCTCGCTTCCGTGGGAAACCCAATTTCTCGTCCTTGCCGCACATGACGATCAACGGCATCTCAAATTCCCAATACGGTAGGGCATCCGAAGGTTCTGGAAGCTTCGGGTACGGAGGCGGTAAGATTTACCGGCGGCTCGGCTCTTGTCTGGTGATACCTCCGACGAAAGGCAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799077.1
MAAAILACNNFPQLKLHLSSPSHFIARASRFRGKPNFSSLPHMTINGISNSQYGRASEGSGSFGYGGGKIYRRLGSCLVIPPTKGRKPKALVKFLGGAFIGAVPEVTYSYLLGLLAEEGYLIISVPYNVTFDHEQVTREIYQRFHTCLDSILSTGLPDCGISAADIADLPFYSVGHSNGALLQVLTGSYFCEKIPKANAIISYNNKSASEAVPYFEQLGPVVKQMMPVIETSPMYSVAQSFSDGWKTLIDLAERVVPDYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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