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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004095`

染色体: Chr03 坐标: 59824630-59825569 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004095`
名称	SmilChr03G004095
描述	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	59824630 - 59825569 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014943`
GeneID	`131014943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014943`
原始查询	`LOC131014943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12-like
产物	CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12-like
Arabidopsis	`AT4G18700` (CIPK12) CBL-interacting protein kinase 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827604] identity=76.9; qcov=0.808; evalue=4.08e-89; confidence=high
Rice	`Os05g0332300` (OsCIPK18) - identity=73.5; qcov=0.724; evalue=5.5e-81; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01163 (RIO1); PF03109 (ABC1); PF06293 (Kdo); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799107.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799107.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799107.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057799107.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799107.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:59824776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B83,C13,C35,C37,C87
`Chr3:59824795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:59824802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C16,D10
`Chr3:59824803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr3:59824826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C13,C35,C37,C87
`Chr3:59824832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B77,B90,B99,C28,C47
`Chr3:59824832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,B90,B99,C28,C47
`Chr3:59824843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,D10
`Chr3:59824846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:59824848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B127,D8
`Chr3:59824850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr3:59824852`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B125,B64,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799107.1

214 aa

107

214

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

RIO1

ABC1

Kdo

PF00069 Pkinase 33-179 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 35-178 aa PF01163 RIO1 74-174 aa PF03109 ABC1 102-178 aa PF06293 Kdo 120-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799107.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	33	179	2.6e-46	158.9	Protein kinase domain
`XP_057799107.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	35	178	7.1e-27	95.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057799107.1`	Pfam	`PF01163`	RIO1	Domain	74	174	2.8e-06	27.8	RIO domain
`XP_057799107.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	102	178	1.1e-08	35.3	ABC1 atypical kinase-like domain
`XP_057799107.1`	Pfam	`PF06293`	Kdo	Family	120	170	0.00012	22.3	Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943124.1
CAAAAAATCAGTTGCGAATTTAGGGTTCTCGATCAAAATCAGCAGCTGTATATTATCTCGCATACTGCAATCGAATTGAGCTTTGAGTAAATAAGTTGTTAAACCCTCGAGATTAGAAGCTAAAATTCACTGCAAATCAATGACCGCCGCCGCCGCCGGCAACAACGGCACAGCCGCAAGTAAATCTCTGAAATCGCCGAAGCAGAAGGAGCTGCAGGGGCTGCTATTAGACCGGTACGACGTCGGAAAGGTCATCGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014943
ATGACCGCCGCCGCCGCCGGCAACAACGGCACAGCCGCAAGTAAATCTCTGAAATCGCCGAAGCAGAAGGAGCTGCAGGGGCTGCTATTAGACCGGTACGACGTCGGAAAGGTCATCGGCCACGGGACCTTCGCGAAGGTGTACCACGCGAGGAACGTGAAGACAGGTGAGGGCGTGGCGATAAAGGTCACCGACAAGGAGAAGATCTTGAAAGTCGGTCTAATGGCGCAAATCAAGCGCGAGATCTCGATCCTGCGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799107.1
MTAAAAGNNGTAASKSLKSPKQKELQGLLLDRYDVGKVIGHGTFAKVYHARNVKTGEGVAIKVTDKEKILKVGLMAQIKREISILRRVRHPNIVQLFEVMATKSKIFFVMEFVKGGELFSKVAKGRLKEEVARKYFQQLISAVAFYHARGVYHRDLKPENILLDEDDNLKVSDFGLSAIPEQVVVVVVVGGGMEVVVVVVVGGGMEVVVGPTTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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