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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002277`

染色体: Chr01 坐标: 39533851-39537286 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002277`
名称	SmilChr01G002277
描述	29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39533851 - 39537286 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131014967`
GeneID	`131014967`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131014967`
原始查询	`LOC131014967`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic
产物	29 kDa ribonucleoprotein A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G35410` (AT2G35410) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818107] identity=60.6; qcov=0.799; evalue=8.76e-95; confidence=high
Rice	`Os04g0591000` - identity=55.9; qcov=0.706; evalue=3.83e-61; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13893 (RRM_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131014967

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799129.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057799129.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799129.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799129.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799129.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39534136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:39534236`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C62
`Chr1:39534236`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C62
`Chr1:39535864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B130,B22,B41,B75
`Chr1:39537001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799129.1

289 aa

144

289

RRM_1

RRM_5

RRM_1

RRM_5

PF00076 RRM_1 89-157 aa PF13893 RRM_5 90-164 aa PF00076 RRM_1 186-256 aa PF13893 RRM_5 226-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799129.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	89	157	2.5e-38	130.5	RNA recognition motif
`XP_057799129.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	90	164	9.4e-09	35.7	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057799129.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	186	256	2.5e-38	130.5	RNA recognition motif
`XP_057799129.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	226	268	9.4e-09	35.7	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943146.1
TATAATTCTCAACAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAGTTATATTGAAACCCTGTAGTTAGAATTTTTTTTTTTATAAAAAAAAGTCGGGATGAAAAATGTAAATAAAAGGGCTTAAAATATGAGGATTGGATATTTTTTATCCAAGTAAGCGGTAGAGTGAGAGCCATGGCTTTGGGAGCGAAGGAGGCAGCATCTTCCATCTTCTCATCTTTCCCTCCAACTTCTCTCCATCTCCATTCATCCAACAAATCTCCATCTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131014967
ATGGCTTTGGGAGCGAAGGAGGCAGCATCTTCCATCTTCTCATCTTTCCCTCCAACTTCTCTCCATCTCCATTCATCCAACAAATCTCCATCTTCAATTAAGTTTCGCCTCTCCAAATCTCCGCCCGCGCTGAAATGCACTCATCACCTTACATTGACTAGGTCTTCCTTTCAGTTGCAATCAGCTGCAGAAATCCCCACAACTGTAGCAGAAGAAGAAGTAGAAAAAATCGAAAAATCCGGAAATCCAAATAGCAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799129.1
MALGAKEAASSIFSSFPPTSLHLHSSNKSPSSIKFRLSKSPPALKCTHHLTLTRSSFQLQSAAEIPTTVAEEEVEKIEKSGNPNSRRKLFVLNLPWSFSVADIKTLFSECGAVSDVEIIKQKDGKNRGFAFVTMANGDGAQAAIEKFDSYEVVGRIIRVQFAKRFKKPVRPAPVVAPPPGETRHKLYVSNLAWKVRSNDLRELFSSNFNPVSARVIFDNPSGRSAGYGFVSFATKEEAESAINELDGKELLGRPIRLKFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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