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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004133`

染色体: Chr03 坐标: 60160228-60170733 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004133`
名称	SmilChr03G004133
描述	L-arabinokinase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60160228 - 60170733 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015003`
GeneID	`131015003`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015003`
原始查询	`LOC131015003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-arabinokinase
产物	L-arabinokinase
Arabidopsis	`AT4G16130` (ARA1) arabinose kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827299] identity=80; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0141300` (CAP1) - identity=73.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00288 (GHMP_kinases_N); PF10509 (GalKase_gal_bdg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015003

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799180.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057799180.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057799180.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799180.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799180.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60160537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr3:60160561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B7,C48
`Chr3:60160877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B59,B72,C64,C66,D11
`Chr3:60161451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:60161553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,C60
`Chr3:60161899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr3:60162849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B8,C33
`Chr3:60163443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B136,C26
`Chr3:60163454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C23,C42
`Chr3:60163504`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr3:60163504`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr3:60163916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799180.1

983 aa

492

983

GalKase_gal_bdg

GHMP_kinases_N

PF10509 GalKase_gal_bdg 490-531 aa PF00288 GHMP_kinases_N 608-696 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799180.1`	Pfam	`PF10509`	GalKase_gal_bdg	Domain	490	531	7e-06	26.2	Galactokinase galactose-binding signature
`XP_057799180.1`	Pfam	`PF00288`	GHMP_kinases_N	Domain	608	696	5.3e-18	65.7	GHMP kinases N terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943197.1
CTCGAGTATTTTTGGTCCTTGATTATTAAATTTGTCCACAATATGGAGATAGTATCGAAGTAACATGATTTGACATCTTTAGAGAGAGAGAGAGGAAGTCAGCGTCATCGTTAACCTCCTCGACTCGAACAACAGACTTCGGATAAAATTGTGGGACTGACTGACACCGAAAGCTGACGTCGATTCCTACCCGCGAACTAATCCAACACTGCTCCCTTTAATTATACCATTTTCTCATTCAAATTTCCACTCAACTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015003
ATGGGAGCACAAGATTCTGCGAAACGACCGCTAGTGTTTGCATATTATGTCACTGGCCATGGTTTCGGCCATGCCACCCGCGTTGTCGAGGTTGCTCGACATCTCATTCTTGCTGGGCATGATGTTCATGTGGTCACTGGTGCACCAGATTATGTTTTTACAACTGAAATACAGTCTCCTCGTCTTTTTCTACGGAAGGTGCTCTTGGATTGTGGAGCAGTTCAAGCAGATGCATTGACAGTTGATCGCCTTGCATCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799180.1
MGAQDSAKRPLVFAYYVTGHGFGHATRVVEVARHLILAGHDVHVVTGAPDYVFTTEIQSPRLFLRKVLLDCGAVQADALTVDRLASLEKYSETAVEPRESILATEVEWLKSIKADFVVSDVVPVACRAAADAGIRSVCVTNFSWDFIYAEYVMAAGHHHRTIVWQIAEDYSHCEFLIRLPGYCPMPAFRDAIDVPLVVRRLHKNREEIRKELGIGEDVKTVILNFGGQPSGWTLKEEFLPSGWLCLVCGASESLDLPPNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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