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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004157`

染色体: Chr03 坐标: 60344305-60348450 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004157`
名称	SmilChr03G004157
描述	glutamate receptor 2.7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60344305 - 60348450 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015026`
GeneID	`131015026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015026`
原始查询	`LOC131015026`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutamate receptor 2.7-like
产物	glutamate receptor 2.7-like
Arabidopsis	`AT2G29120` (GLR2.7) glutamate receptor 2.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817460] identity=49.6; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0429000` (OsGLR2.1) - identity=47.5; qcov=0.903; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004970 (glutamate-gated receptor activity); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00060 (Lig_chan); PF00497 (SBP_bac_3); PF01094 (ANF_receptor); PF10613 (Lig_chan-Glu_bd); PF13458 (Peripla_BP_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799204.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799204.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799204.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799204.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60344469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:60344529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A9,B57,C2,C59
`Chr3:60344573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B28
`Chr3:60344609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:60344635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:60344637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:60344646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B135,B82,C2
`Chr3:60345120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,A7,B32,C73
`Chr3:60345138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A25,B47,C28
`Chr3:60345155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A1,B47,C28
`Chr3:60345155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B47,C28
`Chr3:60345173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799204.1

990 aa

495

990

Peripla_BP_6

ANF_receptor

Lig_chan-Glu_bd

SBP_bac_3

Lig_chan

PF13458 Peripla_BP_6 30-397 aa PF01094 ANF_receptor 50-401 aa PF10613 Lig_chan-Glu_bd 481-570 aa PF00497 SBP_bac_3 486-809 aa PF00060 Lig_chan 587-841 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799204.1`	Pfam	`PF13458`	Peripla_BP_6	Family	30	397	2.5e-19	70.8	Periplasmic binding protein
`XP_057799204.1`	Pfam	`PF01094`	ANF_receptor	Domain	50	401	2.8e-83	280.6	Receptor family ligand binding region
`XP_057799204.1`	Pfam	`PF10613`	Lig_chan-Glu_bd	Domain	481	570	1.7e-11	44.9	Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
`XP_057799204.1`	Pfam	`PF00497`	SBP_bac_3	Domain	486	809	3.6e-10	40.4	Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
`XP_057799204.1`	Pfam	`PF00060`	Lig_chan	Family	587	841	3.1e-35	121.9	Ligand-gated ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943221.1
GTTTCCATATGTGGATGTGACTGTTGACGCATATATAACCGGTAACTATGCCCAAAATAATCATCAACACGTGAATTCTGAGATCTGAAAATTTTGCACAAGATGAAGTTGGAGGCTCGTCTGGTTGTCTTGGTTCTCTTGTTGAACACTTTGTCCATGAATAGCGCCACGGCGCAGAGCACGCCTTTCCCTGTGAGAGTTGGAGTGGTGCTAGACATGGACAACTATGTCGGAAAAATGGGGTTGAAGTGCATCACAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015026
ATGAAGTTGGAGGCTCGTCTGGTTGTCTTGGTTCTCTTGTTGAACACTTTGTCCATGAATAGCGCCACGGCGCAGAGCACGCCTTTCCCTGTGAGAGTTGGAGTGGTGCTAGACATGGACAACTATGTCGGAAAAATGGGGTTGAAGTGCATCACAATGGCGCTCTCGGATTTCTACACCAGAAATGGCCACTACCAGACTCGGCTGCTTCTCAACAAGAGGGACTCCGAGAGAGACATCGTTGGGGCAGCTGCAGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799204.1
MKLEARLVVLVLLLNTLSMNSATAQSTPFPVRVGVVLDMDNYVGKMGLKCITMALSDFYTRNGHYQTRLLLNKRDSERDIVGAAAAALDLLKNVEVQAIIGPLSSMQANFMINLGNKSQVPIITFSASSPSLLSIRSPYFVRAALSDSSQVKAIAAIVQAFGWREVVPIYVDNEFGEGIIPYLADALEQVNVRIPYRSAIPSSATDDEIVAELYKLMTMQTRIFIVHMLTGLGSRLFTKAKLLGMMSEDYSWIITDGMTN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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