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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004189`

染色体: Chr03 坐标: 60569827-60572512 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004189`
名称	SmilChr03G004189
描述	cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1 homolog 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60569827 - 60572512 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015062`
GeneID	`131015062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015062`
原始查询	`LOC131015062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1 homolog 1-like
产物	cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1 homolog 1-like
Arabidopsis	`AT4G31420` (AT4G31420) Zinc finger protein 622 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829269] identity=64.4; qcov=1.01; evalue=9.82e-177; confidence=high
Rice	`Os06g0693500` - identity=62; qcov=1; evalue=2.9e-172; confidence=high
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030687 (preribosome, large subunit precursor); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF12756 (zf-C2H2_2); PF12874 (zf-met)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799245.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057799245.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057799245.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799245.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799245.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60570079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:60570098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,A9
`Chr3:60570782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:60570862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:60571034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B140
`Chr3:60571121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C74,C80
`Chr3:60571396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:60571406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B63
`Chr3:60571458`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C61
`Chr3:60571469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr3:60571484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B134,B34,C36
`Chr3:60571703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C74,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799245.1

410 aa

205

410

zf-met

zf-C2H2_2

PF12874 zf-met 68-92 aa PF12756 zf-C2H2_2 185-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799245.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	68	92	0.0002	22.3	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057799245.1`	Pfam	`PF12756`	zf-C2H2_2	Family	185	287	1.1e-30	106.5	C2H2 type zinc-finger (2 copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943262.1
TAAATTACAGAAATGACCAAAACGACGGCACTTCGTCTCAGAACGCCTATCGCAAGCGCATACGACACCGTAGATTTTCCACTATAAATACAGATCTGCAAAGAAATTTAAAAGCGGCTGCTGAAGAAACCCTTCACTCAAAAAATAACCTCAATTTGATTATATCACAGCAATTATAATCACAGAAAAGGGGAAAAGAGGAGAGGAAGGAGATGCCGGGATTAACGTGCAACGCTTGCAACAAAGAATTCGCAGATGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015062
ATGCCGGGATTAACGTGCAACGCTTGCAACAAAGAATTCGCAGATGATGTTGAACAAAAGCTCCATTACAAATCCGAGTGGCACCGCTACAATCTCAAACGCAAGGTTGCTGGTGTACCAGGAGTGACTGAAACACTCTTCCAAGCTAGACAATCTGCACTTGCTGATGAGAAAAAGAAGCTGAATGAGACTCCCATGCTTTACAGTTGTGGCCTTTGTGGCAAGGGGTATAGAAGTTTGAAAGCCCATGAACAACACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799245.1
MPGLTCNACNKEFADDVEQKLHYKSEWHRYNLKRKVAGVPGVTETLFQARQSALADEKKKLNETPMLYSCGLCGKGYRSLKAHEQHLKSKSHLIRASEATGNIDEGSTIIKPLTRRAPKEPLHHVMEEDEESEESDWEEVDPNEDLLGEASDSLKQLQVNEGTSNDDMDEDEDGDDFEVLDPSCCFMCDLEHDTLESCMVHMHKKHGFFIPDIEYLKDPKGLLTYLGLKVKRDFLCLYCNERCHPFSSLEAVRKHMEAKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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