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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004199`

染色体: Chr03 坐标: 60627061-60630738 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004199`
名称	SmilChr03G004199
描述	U-box domain-containing protein 35-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60627061 - 60630738 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015073`
GeneID	`131015073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015073`
原始查询	`LOC131015073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 35-like
产物	U-box domain-containing protein 35-like
Arabidopsis	`AT2G24370` (AT2G24370) kinase with adenine nucleotide alpha hydrolases-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816973] identity=62.4; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0787200` (OsRLCK87) - identity=57.7; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00582 (Usp); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799272.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799272.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799272.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799272.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799272.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60627556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C72
`Chr3:60627562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:60627766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:60627949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr3:60627967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B140,B7
`Chr3:60628383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:60628506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D9
`Chr3:60628518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr3:60628755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:60628761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:60629080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:60629134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B10,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799272.1

770 aa

385

770

Usp

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00582 Usp 15-163 aa PF00069 Pkinase 464-678 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 465-718 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799272.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	15	163	3e-10	41.5	Universal stress protein family
`XP_057799272.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	464	678	2.8e-39	135.8	Protein kinase domain
`XP_057799272.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	465	718	2.4e-36	126.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943289.1
TGGAAAAAACAAGGAGGGAGGGAGAGAGAGAGAGAGTGAGGATGTTCATCTCTGAGAGAGAAGCAGAGGTTTCGAGCAATACAGAAATATTTGAAGGAAGGAGGGGAATTTGATTCCTAATCATCATATTGATATCAAGCGAGGAAGAACAAGATGTGGCCTCCACCCTCCAACTCTGCAGATAAGATGACTCCGATGACACGGCTGGTTGCCGTGGCCATCGACAAGGACAGAGGCAGCCAGATTGCCCTCAAATGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015073
ATGTGGCCTCCACCCTCCAACTCTGCAGATAAGATGACTCCGATGACACGGCTGGTTGCCGTGGCCATCGACAAGGACAGAGGCAGCCAGATTGCCCTCAAATGGGCTTCCGACAATCTTCTTGTAAGAGGCCAGACCGTTATTTTGGTCCACGTCAGACTCAAACAATCTGCCTCCGGATCTCCGTTGTCCTCTCCATGGCCTAACCAAGCGTCTGATGGTGGAGACGACGTCATCGGAGATGATCCGCAGATGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799272.1
MWPPPSNSADKMTPMTRLVAVAIDKDRGSQIALKWASDNLLVRGQTVILVHVRLKQSASGSPLSSPWPNQASDGGDDVIGDDPQMKELFLPLRVLCTRKDIQRHEVVLDDADVTKALIDFVRQNAIDMLVLGATNKGSIFRFKAKDVPGSILKNAPDFCTVYVIHKGKISSTRAASRPPPSSQLRNQILLQASIKYNNTVEQNSLHSTTSSRSSFSGNSRPGSEQSPRSSRLSDATFKSPFTSRRGPNGRAYDISPPDTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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