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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004202`

染色体: Chr03 坐标: 60638345-60643094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004202`
名称	SmilChr03G004202
描述	probable protein phosphatase 2C 59
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60638345 - 60643094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015075`
GeneID	`131015075`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015075`
原始查询	`LOC131015075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 59
产物	probable protein phosphatase 2C 59
Arabidopsis	`AT4G31750` (WIN2) HOPW1-1-interacting 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829303] identity=86.7; qcov=0.484; evalue=5.91e-130; confidence=medium
Rice	`Os06g0698300` (OsPP2C59) - identity=77.9; qcov=0.509; evalue=5.02e-122; confidence=medium
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C); PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015075

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057799274.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057799274.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057799274.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057799274.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60638639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B23,B66,C39
`Chr3:60638667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr3:60638714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	35	A10,A9,B1,B101,B107,B110,B126,B129,B23,B27,B3,B33,B38,B39,B43,B49,B5,B63,B7,B71,B76,B85,B86,B87,B95,C1,C15,C27,C42,C54,C60,C65,C79,C81,D1
`Chr3:60638750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B23,B66,C39
`Chr3:60638760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:60638876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60638912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B79
`Chr3:60639618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:60639709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:60639736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60640419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C1,C75
`Chr3:60640475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B13,B130,B44,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799274.1

436 aa

218

436

Usp

PP2C

PF00582 Usp 15-163 aa PF00481 PP2C 208-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799274.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	15	163	1.5e-10	42.5	Universal stress protein family
`XP_057799274.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	208	415	8.2e-59	200.1	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943291.1
CATCCAATGAGAATTACAGTCATCTTCTTAATCTCACTTCACCTACCCCTTTTCGTCACTTCATCTCGATCAATCCGCCCACCCGACCCGCAATGCACCCGACCCGACCCCAACACCCTCCGCTCCGACCAGATGACCGTCATCATCAACGGCTTCTCGGAGCACCGGATCCCGCTGCTCCGCTCCATCACCGCCGCCTACGCCGCCTCGCCCTCAGTCGCCCCCGCGCGCCCTCCGCCAGCCTCAATCACCGATTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015075
ATGTGGCCTCCACCCTCCAACTCTGCAGTTAAGATGACTCCGATGACACGGCTGGTTGCCGTGGCCATCGACAAGGACAGAGGCAGCCGGATTGCCCTCAAGTGGGCTTCTGACAATCTTCTTGTAAGAGGCCAGACCGTTATTTTGGTCCACGTCAGACTCAAACAATCTGCCTCCGGATCTCCGTTGTCCTCTCCTTGGCCTAACCAAGCGTCTGATGGTGGAGACGACGTCATCAGAGATGATCCGCAGATGAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799274.1
MWPPPSNSAVKMTPMTRLVAVAIDKDRGSRIALKWASDNLLVRGQTVILVHVRLKQSASGSPLSSPWPNQASDGGDDVIRDDPQMKELFLPFRVFCTRKDIQRHEVVLDNADVTKALIDFVRQNAIDMLVLGATNKGSIFRFKAKDVPGSILKNAPDFCTVYVIHKGKISSTRAATRPPPSSQLRNQILLQASIKYNNTVEQNSLHSTTSSRSHGGARAAEYVKQNLFSNLIRHPKFITDTKLAISDAYSHTDSEFLKSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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