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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004207`

染色体: Chr03 坐标: 60676986-60679388 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004207`
名称	SmilChr03G004207
描述	sphingosine kinase 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60676986 - 60679388 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015083`
GeneID	`131015083`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015083`
原始查询	`LOC131015083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sphingosine kinase 1-like
产物	sphingosine kinase 1-like
Arabidopsis	`AT4G21540` (SPHK1) sphingosine kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828239] identity=61.4; qcov=0.518; evalue=4.52e-13; confidence=low
Rice	`Os01g0782200` - identity=57.8; qcov=0.529; evalue=4.34e-12; confidence=low
GO	GO:0016301 (kinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00781 (DAGK_cat)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015083

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057799300.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057799300.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057799300.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799300.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799300.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60677373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:60677382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,D6
`Chr3:60677561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B14,B26,B80,B95
`Chr3:60677580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:60679166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799300.1

86 aa

DAGK_cat

PF00781 DAGK_cat 22-62 aa

XP_057799301.1

85 aa

DAGK_cat

PF00781 DAGK_cat 22-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799300.1`	Pfam	`PF00781`	DAGK_cat	Family	22	62	8.4e-07	29.3	Diacylglycerol kinase catalytic domain
`XP_057799301.1`	Pfam	`PF00781`	DAGK_cat	Family	22	62	8.3e-07	29.4	Diacylglycerol kinase catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098457.1
ATAAACACCCCAAAATTGGAAACTAGTACTACATTGCAAAAAAGTACATCAGCGTGAATTCATTTTCTTCTCCATCTCCTAAGTATCAAAACAGAGCAAAATCGAAACCCTAATTCAGATCGTCACTCGCCTCCGCCGCCCCTTCTCCTCGGGCGTCGACGCGTTCTTCGTCGTCGACGCCTTCTCATCGCTGCCCTCCGTTGCTCTACGCCAAAGCCCCCAATTCTGTCTCCGACGCCTTCCTTTATTTCTCCTACCTC...

XR_009098456.1
AAAAAAGTACATCAGCGTGAATTCATTTTCTTCTCCATCTCCTAAGTATCAAAACAGAGCAAAATCGAAACCCTAATTCAGATCGTCACTCGCCTCCGCCGCCCCTTCTCCTCGGGCGTCGACGCGTTCTTCGTCGTCGACGCCTTCTCATCGCTGCCCTCCGTTGCTCTACGCCAAAGCCCCCAATTCTGTCTCCGACGCCTTCCTTTATTTCTCCTACCTCTTCAAGTCTCTCTCCCTCCTCCTTCCCCATTTCTCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015083
ATGGCACTGCTCAACGGCCGCGCTGTGCTGCACTTCTGCCTCCGTTGCAGCTGCCCTATCTCGAAGCTGGAAGAAACCAAACACCAGCTGCACGCGAAGAAAGTCGCTCAGTCGCTAGATCTGGAAAAATTTGATGGAATCGTTTGCGTTAGTGGAGATGGAATTCTAGTTGAGGCGTATCAAGTGGAACTGGAGTTAATGGTGGTGAGACTAGAGAAAGAAAATGAGCAGCTGTTAAAACAGAAGAAGGGCGAGCATTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799300.1
MALLNGRAVLHFCLRCSCPISKLEETKHQLHAKKVAQSLDLEKFDGIVCVSGDGILVEAYQVELELMVVRLEKENEQLLKQKKGEH

XP_057799301.1
MALLNGRAVLHFCLRCSCPISKLEETKHQLHAKKVAQSLDLEKFDGIVCVSGDGILVEAYQVELELMVVRLEKENEQLLKQKGEH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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