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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004209`

染色体: Chr03 坐标: 60692976-60696190 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004209`
名称	SmilChr03G004209
描述	aspartyl protease family protein At5g10770-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60692976 - 60696190 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015085`
GeneID	`131015085`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015085`
原始查询	`LOC131015085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease family protein At5g10770-like
产物	aspartyl protease family protein At5g10770-like
Arabidopsis	`AT5G10770` (AT5G10770) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830944] identity=58.7; qcov=0.846; evalue=2.32e-166; confidence=high
Rice	`Os09g0482500` - identity=47; qcov=0.93; evalue=2.65e-129; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015085

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057799302.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057799302.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799302.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799302.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799302.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60693104`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	147	A1,A10,A14,A16,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B117,B119,B12,B120,B121,B124,B126,B127,B128,B132,B134,B135,B136,B138,B140,B17,B18,B20,B22,B23,B28,B3,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B49,B5,B54,B55,B56,B58,B60,B65,B67,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B91,B93,B96,C10,C11,C13,C15,C16,C18,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C27,C3,C30,C32,C33,C36,C37,C38,C4,C40,C44,C46,C47,C49,C5,C53,C57,C58,C6,C60,C62,C63,C68,C69,C70,C71,C73,C75,C77,C80,C81,C83,C84,C85,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D7,D8
`Chr3:60693129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:60693152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B131
`Chr3:60693155`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	187	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B117,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B49,B5,B51,B54,B55,B56,B6,B60,B65,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B96,B99,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C3,C30,C32,C33,C36,C37,C38,C4,C40,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C52,C53,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D6,D7,D8
`Chr3:60693194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B7,C19,C58
`Chr3:60693205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C31
`Chr3:60693228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B93
`Chr3:60693229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:60693234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B131
`Chr3:60693239`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A7,B54,B7,C19,C38,C58
`Chr3:60693244`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A7,B54,B7,C19,C38,C58
`Chr3:60693265`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A7,B7,C19,C38,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799302.1

487 aa

244

487

Asp

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF00026 Asp 140-196 aa PF14543 TAXi_N 141-309 aa PF00026 Asp 217-478 aa PF14541 TAXi_C 332-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799302.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	140	196	6.5e-26	92.2	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057799302.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	141	309	1.5e-53	182.3	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057799302.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	217	478	6.5e-26	92.2	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057799302.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	332	478	1.9e-29	103.2	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943319.1
ATGGAAGCCAATTTATCACAACTCACATCAAACAGAAAAACCACTCACATTCACATTCACTCATGGCCACTCTCCATTTCTTCTTCACCTTCATCAATTCTTTTTTCCTTTTCTTGGTTTTCATTTCATGTTTTTCAGAGCAAACCCATGCTTTTGAAGCCAAAAATACTAGGACTCAAGACTCTTCTTTCCACACAATTCAAATTAGCTCTCTTTTTCCATCATCTGTTTGCAGTCCTTCCAAAGATTTAATCAAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015085
ATGGCCACTCTCCATTTCTTCTTCACCTTCATCAATTCTTTTTTCCTTTTCTTGGTTTTCATTTCATGTTTTTCAGAGCAAACCCATGCTTTTGAAGCCAAAAATACTAGGACTCAAGACTCTTCTTTCCACACAATTCAAATTAGCTCTCTTTTTCCATCATCTGTTTGCAGTCCTTCCAAAGATTTAATCAAGAAGAGGCCGTCCACACTAGAAGTTTTCCATCGTCACGGCCCGTGTTCGAAACTCAGTCAAGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799302.1
MATLHFFFTFINSFFLFLVFISCFSEQTHAFEAKNTRTQDSSFHTIQISSLFPSSVCSPSKDLIKKRPSTLEVFHRHGPCSKLSQDEAARRPSLKDILSHDQSRVESINARLNPTSNTDKVNDKKVNLPVTPGSSLGSGNYLISVGLGTPKKTLSLIFDTGSDLTWTQCQPCSRSCYKQQDPIFDPKTSTSYSNVSCTSTSCSQLSSATGNTPSCNVGTCVYGIQYGDQSFSVGLFSKDTLTIASDVFPNFQFGCGQNNQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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