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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004231`

染色体: Chr03 坐标: 60850449-60852672 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004231`
名称	SmilChr03G004231
描述	uncharacterized SmilChr03G004231
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	60850449 - 60852672 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015106`
GeneID	`131015106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015106`
原始查询	`LOC131015106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=26; qcov=0.537; evalue=1.51e-08; confidence=low
Rice	`Os02g0328500` - identity=31.1; qcov=0.519; evalue=3.05e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799340.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799340.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799340.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799340.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:60850869`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A3
`Chr3:60850869`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A3
`Chr3:60850875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B15,B55
`Chr3:60851434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:60851437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,C61,C70
`Chr3:60851461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr3:60851515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B35
`Chr3:60851557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B76,C17,C63,C73
`Chr3:60851565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr3:60851611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr3:60851659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr3:60851671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,C76,C8,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799340.1

322 aa

161

322

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 26-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799340.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	26	122	3.3e-07	31.9	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943357.1
CGTTTGATTTCCTGTTTAGGATTGTTTAGGATTAAAATTATCCTGAGAAATTAGTATGGATTAGTGTGGGTTTTTATTATTCCATGGGTGTTTGATATCATGTCTACTTAATCCTATATGGTGTTTGATATCCATAGGATTAAGTTGGATTATATTTTATAATACCTAAACTAACCTCATAAAATTTTAATAATTCCAAGTGTGTCCTCCATCAAAGCCCATAATCTATTCATACACCAATCGGCCCTTTCATCTTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015106
ATGAGTCAAGCAACAACAGGTAGCAATGGCGCAGCCCGTTCCAGCAAGCCCAACAAGACGGACCAAAAGCGTCGTTCTTGGTCCACTCACGAAGAACATGTGTTGCTCGCCTCGTTGAAAGAACTTGTTGCAAACGGTTGGAAATCCGACAATGGATTTCGAGGCGGGTATTTGAGCAAACTCGAGGAGGCCATGAGGAAGGAGTACCCCGACTCTGATTTGAAGGGAACGCCCCACATCAACTCGAAGGTGACAACATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799340.1
MSQATTGSNGAARSSKPNKTDQKRRSWSTHEEHVLLASLKELVANGWKSDNGFRGGYLSKLEEAMRKEYPDSDLKGTPHINSKVTTWKKTYYSLWNILKVSGVGFNVNGKHMIDCDDEQWQSFVAADKNVTNFRYKSWPYYEDWKLIFGKDRATGDEAEDLMEAAHEMYQKLSSSPLNDLGDYHVSLDDIFENDLTGDNVSQTPNQQETIPIEQEAPTTSKKRRRSGGFDEKFFEALHEVGRGTESRLETISCRMGYDFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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