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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004256`

染色体: Chr03 坐标: 61045354-61047256 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004256`
名称	SmilChr03G004256
描述	cytochrome P450 71D13-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61045354 - 61047256 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015133`
GeneID	`131015133`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015133`
原始查询	`LOC131015133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 71D13-like
产物	cytochrome P450 71D13-like
Arabidopsis	`AT3G26330` (CYP71B37) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822237] identity=41.3; qcov=0.895; evalue=6.99e-125; confidence=medium
Rice	`Os09g0275400` - identity=44.4; qcov=0.886; evalue=4.98e-141; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00909 (Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015133

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057799373.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057799373.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799373.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799373.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799373.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61045421`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B26,B69
`Chr3:61045421`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B26,B69
`Chr3:61045423`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	94	A1,A13,A15,A18,A23,A25,A3,A4,A7,B100,B105,B106,B110,B111,B112,B113,B117,B120,B128,B129,B133,B135,B137,B15,B16,B17,B23,B25,B27,B3,B30,B31,B37,B40,B42,B45,B46,B47,B48,B5,B51,B53,B54,B61,B62,B64,B65,B66,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B86,B89,B91,B93,B96,C10,C15,C19,C20,C24,C25,C3,C30,C33,C37,C38,C4,C46,C48,C5,C53,C56,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C74,C76,C78,C79,C81,C83,C84,D1,D5,D8
`Chr3:61045431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61045880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B88
`Chr3:61046048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B34
`Chr3:61046247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr3:61046257`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A23,A4,A6,B102,B105,B115,B130,B131,B19,B20,B21,B25,B42,B43,B45,B59,B68,B69,B83,B88,B91,B94,B98,C11,C15,C24,C35,C36,C39,C49,C57,C58,C65,C69,C85,D4
`Chr3:61046499`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A23,B70,B98,C46,C60,C65
`Chr3:61046506`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A23,B70,B98,C60,C65
`Chr3:61046506`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A23,B70,B98,C60,C65
`Chr3:61046511`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A23,B70,B98,C60,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799373.1

544 aa

272

544

p450

PF00067 p450 64-518 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799373.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	64	518	5e-96	323.0	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943390.1
CAAAAAATACTATATAAACTCATCCACTTCCCATGCAAATTTATCAACTCACAACACACAACTCTCTCTCTCTGTCTCTTTTGAGAGAGATTAATATAATGGATTCGATTTTGGGGGTATCATTACTATCATGGAACTTCATGGCTCTAGCTGTGATCCTTCCCATAGCGATCTTCTTCATCAGAAGCAAGACAAGATCCAAACCCGTTTCCAGCAACTGGCCGCCCGGCCCGAAGACCCTACCCGTGATCGGAAACATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015133
ATGCAAATTTATCAACTCACAACACACAACTCTCTCTCTCTGTCTCTTTTGAGAGAGATTAATATAATGGATTCGATTTTGGGGGTATCATTACTATCATGGAACTTCATGGCTCTAGCTGTGATCCTTCCCATAGCGATCTTCTTCATCAGAAGCAAGACAAGATCCAAACCCGTTTCCAGCAACTGGCCGCCCGGCCCGAAGACCCTACCCGTGATCGGAAACATGCATCTCCTGAGCGCTCTGGCGTTCCGATCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799373.1
MQIYQLTTHNSLSLSLLREINIMDSILGVSLLSWNFMALAVILPIAIFFIRSKTRSKPVSSNWPPGPKTLPVIGNMHLLSALAFRSISELAKQYGPLMRLKLGEVDTIVVSSREVAREMLKQHDPCYADRPESIGIKVLWYNYRDIAFSPYGDYWRQMRKICIMELLSPRSVRSFASIRTDEVSNLIASIRASAAAGNPVNISDSIFSMMSSVTCRAAFGKVSKDKDALIRILRDGIQMAGGFEIADFFPSSLIINTFSW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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