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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004260`

染色体: Chr03 坐标: 61095923-61098817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004260`
名称	SmilChr03G004260
描述	chorismate mutase 2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61095923 - 61098817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015138`
GeneID	`131015138`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015138`
原始查询	`LOC131015138`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chorismate mutase 2
产物	chorismate mutase 2
Arabidopsis	`AT5G10870` (CM2) chorismate mutase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830954] identity=56.2; qcov=1.04; evalue=2e-105; confidence=high
Rice	`Os02g0180500` - identity=51.2; qcov=0.984; evalue=4.76e-86; confidence=high
GO	GO:0004106 (chorismate mutase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009073 (aromatic amino acid biosynthetic process); GO:0046417 (chorismate metabolic process)
KEGG	smil00400 (Phenylalanine, tyrosine and tryptophan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01817 (CM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015138

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799377.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799377.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057799377.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057799377.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799377.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61097177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr3:61097187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr3:61097188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B13,C1
`Chr3:61097205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C76
`Chr3:61097216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C76
`Chr3:61097878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:61097887`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr3:61097887`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr3:61097889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:61097935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B69
`Chr3:61098032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C76
`Chr3:61098505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799377.1

254 aa

127

254

CM_2

PF01817 CM_2 138-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799377.1`	Pfam	`PF01817`	CM_2	Domain	138	245	9.4e-08	32.9	Chorismate mutase type II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943394.1
ACGCATATACATACATGGCCTCAAAATGCTTGTTATTTATAGTGATATTTTCGTGTGGTTTGACGGCTTATTCTCTACCAAACACTTCTGCTGCCAATGCCAATGCCTCGTTTTATAAACCAGGTACTTACGTTTTATTTGGACCGTTGGTTTTTTATTCATTATGTACCAATTGTTGTGAATATTATTTTTTCTTTAGCCTGCGTTTATTTAGATGGATAAATTTATCTATTAAAAATGATGAATAATACAAATTTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015138
ATGGGTGATTGTGGTGAAACGGAGCAAGGCGCGTATCTGGACAGCTTGCTGAATCTGGAATCGTTGAGGCAGAGCCTGGTGCGGCAGGAAGACACCATCATCTTCAGCCTGATTGAGAGGTCCAGATATCCGATCAACTCGCGCTTGTACGATCAATCCGCCGCTCCTTCTCTCTTGCGCTTCTTCCTCGAGGAATCCGAAGCTGTTCAAGCTAAGGCTGGTCGTTACACTTCACCGGAAGAAAACGCCTTCTTCCCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799377.1
MGDCGETEQGAYLDSLLNLESLRQSLVRQEDTIIFSLIERSRYPINSRLYDQSAAPSLLRFFLEESEAVQAKAGRYTSPEENAFFPDSLPHPMLPPPKHKPVLHPSGACININDKIISHYLETLVPLVATKGDDGNYAATAATDLACLQALSRRIHFGKFVAEVKFRDSPQDYTPAILAKDKEGLMKLLTFESVEEAIKKRVEKKAMVFGQDVGLQENGSRYKVKPALVSQMYGDWLIPLTKFVQVEYLLRRLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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