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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004281`

染色体: Chr03 坐标: 61235991-61239443 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004281`
名称	SmilChr03G004281
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61235991 - 61239443 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015156`
GeneID	`131015156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015156`
原始查询	`LOC131015156`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	premnaspirodiene oxygenase-like
产物	premnaspirodiene oxygenase-like
Arabidopsis	`AT3G26330` (CYP71B37) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 37 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822237] identity=42.6; qcov=0.813; evalue=1.44e-125; confidence=medium
Rice	`Os09g0275400` - identity=44.8; qcov=0.798; evalue=6.8e-145; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057799410.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057799410.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799410.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799410.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61236874`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A13,A16,A20,A24,A3,B102,B117,B124,B126,B127,B131,B2,B20,B26,B3,B31,B52,B53,B65,B7,B89,B97,C1,C12,C15,C2,C45,C5,C52,C54,C55,C60,C63,C64,C66,C67,C79,C86,C9
`Chr3:61236876`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A1,A10,A14,A15,A23,A5,A8,B10,B103,B104,B113,B119,B122,B128,B130,B133,B139,B17,B23,B24,B29,B30,B4,B59,B83,B85,B87,B9,C24,C4,C41,C43,C53,C73,C77,D2,D3,D6,D9
`Chr3:61237326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B123
`Chr3:61237332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B22
`Chr3:61237349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B136,B22
`Chr3:61237349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B22
`Chr3:61237351`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B132,C16,D7
`Chr3:61237351`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B132,C16,D7
`Chr3:61237371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B137,B61,C74
`Chr3:61237389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B24
`Chr3:61237478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B22
`Chr3:61237491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799410.1

595 aa

298

595

p450

PF00067 p450 119-569 aa

XP_057799411.1

595 aa

298

595

p450

PF00067 p450 119-569 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799410.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	119	569	2.3e-100	337.3	Cytochrome P450
`XP_057799411.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	119	569	2.3e-100	337.3	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943427.1
CATTCTCTGCGTTGTAGTACAATGGAGCAGACTCAAGAAAATAGAAGACTAGAAGCTCGGATTTGGAGCGAGGTTTTCATTGTCTGCGCTGAAGGATTAAGTGATTAACCCTACTCTCTCACTAAAAAGTTGGTGCATGGAGAATATAGCTTGGAGAAGGATGTCTTGAGCAAAGAAGGCACTTCTGCAACAACAGATGGCTCAAATGGTGGTTTATGTCATTCCGAGTTGACTCCTCGAACACCGCAGTTCAGTTCAAA...

XM_057943428.1
GGATTAAGTGATTAACCCTACTCTCTCACTAAAAAGTTGGTGCATGGAGGTGACCAATTTCATGAATTTGTTGTTTCTTACAATTATATTTGGGATAAGATGTTGTGGATGATCATTTTGTGGAGTTATCTGTGTGTTGAGAATATAGCTTGGAGAAGGATGTCTTGAGCAAAGAAGGCACTTCTGCAACAACAGATGGCTCAAATGGTGGTTTATGTCATTCCGAGTTGACTCCTCGAACACCGCAGTTCAGTTCAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015156
ATGTCATTCCGAGTTGACTCCTCGAACACCGCAGTTCAGTTCAAAGATCCGATAACACAGGTTGTCTGTTGCTGCCCGTGCTCCTCCTCGAACTCGAAGAAGCAGAAACAGATCGCTGAGCTAACAGAAAACAGGAGGCACACGAACACAACGCTGGAGAATCTGAAAGGTAATATTTCAGAACAGAGTTCAGGCGATAGCAAGAAATTATGTAGCAGTCCGATGTTTTGTCTCTCTATTGTTCGGCCTGAAATGGAAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799410.1
MSFRVDSSNTAVQFKDPITQVVCCCPCSSSNSKKQKQIAELTENRRHTNTTLENLKGNISEQSSGDSKKLCSSPMFCLSIVRPEMETVIQFAFSFIAFLSSWIIEGRKEVKPPDRRRLPPGPPRLPVIGHLHHIIGPLPHHYPLRNLASKYGPLMHLKFGEVTAIIVSSAEVAEKVLKTHDPACADRPKSVATQIMWYNYSDIVFSPYGDYWRQMRKICILELLSAKNVRSFEYIRKDEASLLIESIQSTRGAPFNLTEK...

XP_057799411.1
MSFRVDSSNTAVQFKDPITQVVCCCPCSSSNSKKQKQIAELTENRRHTNTTLENLKGNISEQSSGDSKKLCSSPMFCLSIVRPEMETVIQFAFSFIAFLSSWIIEGRKEVKPPDRRRLPPGPPRLPVIGHLHHIIGPLPHHYPLRNLASKYGPLMHLKFGEVTAIIVSSAEVAEKVLKTHDPACADRPKSVATQIMWYNYSDIVFSPYGDYWRQMRKICILELLSAKNVRSFEYIRKDEASLLIESIQSTRGAPFNLTEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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