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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004447`

染色体: Chr03 坐标: 62609711-62615303 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004447`
名称	SmilChr03G004447
描述	protein EMBRYONIC FLOWER 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62609711 - 62615303 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015224`
GeneID	`131015224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015224`
原始查询	`LOC131015224`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EMBRYONIC FLOWER 1-like
产物	protein EMBRYONIC FLOWER 1-like
Arabidopsis	`AT5G11530` (EMF1) embryonic flower 1 (EMF1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831025] identity=36.1; qcov=0.144; evalue=4.26e-13; confidence=weak
Rice	`Os01g0229300` (CCP1) - identity=39; qcov=0.111; evalue=8.57e-07; confidence=weak
GO	GO:0009910 (negative regulation of flower development); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF28218 (EMF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799496.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799496.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799496.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799496.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799496.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62610976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:62611697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B109,B125,B83
`Chr3:62611797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr3:62612409`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A21,A6,B100,B105,B115,B121,B132,B134,B136,B137,B16,B41,B47,B65,B67,B81,B82,B84,B85,B93,C10,C14,C16,C18,C3,C4,C40,C45,C51,C53,C56,C70,D7,D9
`Chr3:62612436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B123,B24,B57
`Chr3:62612475`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B118,B24,B57,C80
`Chr3:62612475`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B118,B24,B57,C80
`Chr3:62612482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,C11,C41,C61
`Chr3:62612484`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B18,B68,B77,C31
`Chr3:62612484`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B18,B68,B77,C31
`Chr3:62612501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:62612605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799496.1

930 aa

465

930

EMF1

PF28218 EMF1 24-919 aa

XP_057799497.1

930 aa

465

930

EMF1

PF28218 EMF1 24-919 aa

XP_057799498.1

904 aa

452

904

EMF1

PF28218 EMF1 24-152 aa PF28218 EMF1 166-893 aa

XP_057799499.1

904 aa

452

904

EMF1

PF28218 EMF1 24-152 aa PF28218 EMF1 166-893 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799496.1`	Pfam	`PF28218`	EMF1	Family	24	919	1.3e-161	541.5	Embryonic flower 1
`XP_057799497.1`	Pfam	`PF28218`	EMF1	Family	24	919	1.3e-161	541.5	Embryonic flower 1
`XP_057799498.1`	Pfam	`PF28218`	EMF1	Family	24	152	5.7e-159	532.7	Embryonic flower 1
`XP_057799498.1`	Pfam	`PF28218`	EMF1	Family	166	893	5.7e-159	532.7	Embryonic flower 1
`XP_057799499.1`	Pfam	`PF28218`	EMF1	Family	24	152	5.7e-159	532.7	Embryonic flower 1
`XP_057799499.1`	Pfam	`PF28218`	EMF1	Family	166	893	5.7e-159	532.7	Embryonic flower 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943513.1
ATAGGGCGACAGTAAACTCAACTCTCCGCATTAAAGAAAAAGGAAATATAACTCAGCTCCTCCCCCTCTCTCTCTCCCTTCATTTCTCATGTTTCTCTCTCTAAAACATTTCTCCTCTCTTTCGCTATCGGATTTCAGACCTAAAACGCTAGGGCACTCGGTGGTTTCCGACGCGAATTCGTCGGCGCAGCCGTGGAATTAAATCACTCGGAGGAGATTGCTTTTGTGAGGGGAGCTAATTGTGGGGGGATTTATATCTG...

XM_057943515.1
GACAGTAAACTCAACTCTCCGCATTAAAGAAAAAGGAAATATAACTCAGCTCCTCCCCCTCTCTCTCTCCCTTCATTTCTCATGTTTCTCTCTCTAAAACATTTCTCCTCTCTTTCGCTATCGGATTTCAGACCTAAAACGCTAGGGCACTCGGTGGTTTCCGACGCGAATTCGTCGGCGCAGCCGTGGAATTAAATCACTCGGAGGAGATTGCTTTTGTGAGGGGAGCTAATTGTGGGGGGATTTATATCTGGTCGATC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131015224
ATGGATATTGTTGTAATGGAAGAAACTGCTGGGAACAGTGATTTTTCGGATCCCACGTCGAAGTTGGGATCATTTGTTCAGATTAACTCAATAGCTATCGACATTAGTAGTTCAATGGAAGCAATCGAGCCACTAGAACATGAGCATTTTTCTATACGTGGTTTTGTTGCTGGGATGAGAAAAAAGGATTGGAAGACATGTTTTCCATTTGCACCTCAAGGCAACGATGTTGATCCGGTGAATTATCTGCCTCCTCTATT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057799496.1
MDIVVMEETAGNSDFSDPTSKLGSFVQINSIAIDISSSMEAIEPLEHEHFSIRGFVAGMRKKDWKTCFPFAPQGNDVDPVNYLPPLFVPEFRWWQCSSCIPKDEMKRTTKGMAITTKCKANTSSCENVGAKDGLSIHRRDNTEGEDNDQSKINKTPNLCCSERHKDITCSKGKTDIRDIEAGNSCDMPEVDPLQVIEGLNNTPDATDMVCLADHPSCVVVEPDNVSSGSDGPLSVLPHKRKPKLRSLADILVEERNQTSS...

XP_057799497.1
MDIVVMEETAGNSDFSDPTSKLGSFVQINSIAIDISSSMEAIEPLEHEHFSIRGFVAGMRKKDWKTCFPFAPQGNDVDPVNYLPPLFVPEFRWWQCSSCIPKDEMKRTTKGMAITTKCKANTSSCENVGAKDGLSIHRRDNTEGEDNDQSKINKTPNLCCSERHKDITCSKGKTDIRDIEAGNSCDMPEVDPLQVIEGLNNTPDATDMVCLADHPSCVVVEPDNVSSGSDGPLSVLPHKRKPKLRSLADILVEERNQTSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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