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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004440`

染色体: Chr03 坐标: 62547696-62559125 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004440`
名称	SmilChr03G004440
描述	protein ANTI-SILENCING 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62547696 - 62559125 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015225`
GeneID	`131015225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015225`
原始查询	`LOC131015225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ANTI-SILENCING 1
产物	protein ANTI-SILENCING 1
Arabidopsis	`AT5G11470` (AT5G11470) bromo-adjacent homology (BAH) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831018] identity=54.7; qcov=0.183; evalue=1.27e-48; confidence=weak
Rice	`Os01g0610300` - identity=53.5; qcov=0.198; evalue=8.1e-58; confidence=weak
GO	GO:0003682 (chromatin binding); GO:0003723 (RNA binding); GO:0051570 (GO:0051570); GO:1905642 (GO:1905642)
KEGG	-
Pfam	PF01426 (BAH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799501.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799501.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799501.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799501.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62548534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B111,C24,C40
`Chr3:62548775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr3:62548826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B69,C13
`Chr3:62551566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,D10
`Chr3:62551837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,D4
`Chr3:62551854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C37,C38
`Chr3:62552030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr3:62552383`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C59
`Chr3:62552383`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C59
`Chr3:62552399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:62552673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62553047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799501.1

923 aa

462

923

BAH

PF01426 BAH 42-142 aa

XP_057799502.1

923 aa

462

923

BAH

PF01426 BAH 42-142 aa

XP_057799503.1

867 aa

434

867

BAH

PF01426 BAH 42-143 aa

XP_057799504.1

867 aa

434

867

BAH

PF01426 BAH 42-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799501.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	42	142	1.6e-14	54.6	BAH domain
`XP_057799502.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	42	142	1.6e-14	54.6	BAH domain
`XP_057799503.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	42	143	1.4e-14	54.7	BAH domain
`XP_057799504.1`	Pfam	`PF01426`	BAH	Domain	42	143	1.4e-14	54.7	BAH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943519.1
AGCCCAAACCCTTAAAAGACTCTTTTCTTCCTCACTTTCTCGATCCTTCTCCCTCTCTCTCTGTGACTACTGCTCAGTTGCTAGTGCTATTATCCTCTATCTCATTCCGCAGCAGCAACGTCGCAGGTATTTCTCAAAAAAAAAAAAACGTCGCAGGTGCTTGATTATTACCGAAATTATATTCTGTCGTAAAGTCATGTTAGCTCTCACCGGACCAGAGGAACTTGAGAATCCTGCATTCAAATGGGATAAGAAGAGAG...

XM_057943518.1
AGCCCAAACCCTTAAAAGACTCTTTTCTTCCTCACTTTCTCGATCCTTCTCCCTCTCTCTCTGTGACTACTGCTCAGTTGCTAGTGCTATTATCCTCTATCTCATTCCGCAGCAGCAACGTCGCAGGTGCTTGATTATTACCGAAATTATATTCTGTCGTAAAGTCATGTTAGCTCTCACCGGACCAGAGGAACTTGAGAATCCTGCATTCAAATGGGATAAGAAGAGAGGACTGGGAGGGAAGAACAAAAACGTCCAGT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131015225
ATGTTAGCTCTCACCGGACCAGAGGAACTTGAGAATCCTGCATTCAAATGGGATAAGAAGAGAGGACTGGGAGGGAAGAACAAAAACGTCCAGTTTTATGAGTCATTTAGTTATGATGGGATGGATTATGCATTGTATGACTGTGTATATATGCACAAGGAAGGGGCTCCTGCACCTTATATTGGAAAACTGGTTAAGATATGGGAAACTGCTGAAGGCTTAAAAAAGGTAAAGGTTCACTGGTTTTTCCGGCCATCAGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057799501.1
MLALTGPEELENPAFKWDKKRGLGGKNKNVQFYESFSYDGMDYALYDCVYMHKEGAPAPYIGKLVKIWETAEGLKKVKVHWFFRPSEISYYLKDAKVSENELFFASGDGKGLANLNPLEAIAGKCNVVCTSTDNRNQQPSAKELQMADYVFYRVFDVNSCTISDQIDDTVGGLEVNFVFNRRDGIGTLDGPKLDAGEKYEGNMVAFKETPGNNSPQQLRNTKLDKNGNHALDDNTHAMQVLVKQGNLDDKHFSGVDVISS...

XP_057799502.1
MLALTGPEELENPAFKWDKKRGLGGKNKNVQFYESFSYDGMDYALYDCVYMHKEGAPAPYIGKLVKIWETAEGLKKVKVHWFFRPSEISYYLKDAKVSENELFFASGDGKGLANLNPLEAIAGKCNVVCTSTDNRNQQPSAKELQMADYVFYRVFDVNSCTISDQIDDTVGGLEVNFVFNRRDGIGTLDGPKLDAGEKYEGNMVAFKETPGNNSPQQLRNTKLDKNGNHALDDNTHAMQVLVKQGNLDDKHFSGVDVISS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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