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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004349`

染色体: Chr03 坐标: 61751287-61753979 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004349`
名称	SmilChr03G004349
描述	uncharacterized SmilChr03G004349
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61751287 - 61753979 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015232`
GeneID	`131015232`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015232`
原始查询	`LOC131015232`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=39.7; qcov=0.57; evalue=4.3e-96; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015232

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799512.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057799512.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799512.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799512.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61752633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C25
`Chr3:61752635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:61752884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C84
`Chr3:61752905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B68
`Chr3:61752906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B102,B104,B18,C2
`Chr3:61752948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:61752955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr3:61752960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B68,C48
`Chr3:61752975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C40,C64
`Chr3:61752997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B68,C48
`Chr3:61753023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr3:61753028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B78,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799512.1

751 aa

376

751

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF02992 Transposase_21 2-128 aa PF13960 DUF4218 312-425 aa PF13952 DUF4216 594-667 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799512.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	2	128	4.4e-37	128.1	Transposase family tnp2
`XP_057799512.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	312	425	1.1e-40	138.8	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057799512.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	594	667	1.6e-17	64.5	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943529.1
ACCCAAAGATGAAGTTGGACGTATTCTTACAGCCATTGATACACGAGTTAAAATCTCTGTGGGAGGTTGGTGTGAACACTTACGACATATCGTTGAAGCAAAATTTCCAGATGCGAGCAGCTCTGATATGGACTATCAGTGATTTTCCAGCGTACGCTATGTTGTCTGGGTGGGGTACAGCTGGGAAATTGGCATGTCCACATTGCATGGAGAATACAGAAGCATTCACTTTGCCGATGAGTGGAAAACAATCGTGGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015232
ATGAAGTTGGACGTATTCTTACAGCCATTGATACACGAGTTAAAATCTCTGTGGGAGGTTGGTGTGAACACTTACGACATATCGTTGAAGCAAAATTTCCAGATGCGAGCAGCTCTGATATGGACTATCAGTGATTTTCCAGCGTACGCTATGTTGTCTGGGTGGGGTACAGCTGGGAAATTGGCATGTCCACATTGCATGGAGAATACAGAAGCATTCACTTTGCCGATGAGTGGAAAACAATCGTGGTTTGATAATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799512.1
MKLDVFLQPLIHELKSLWEVGVNTYDISLKQNFQMRAALIWTISDFPAYAMLSGWGTAGKLACPHCMENTEAFTLPMSGKQSWFDNHRKFLPPNHVFRRNKTSFLRNKTCNVGPPEQRSGIQILNQIEGLGFVKVTEDFDGRNAQLAKYQDVGWKKKSIFWDLPYWRYLLIRHNLDVMHIEKNVFDNVFNTVLNVKGKTKDTEKSREELNTFCKRKELKKVDGTRGYPKACYTLDREEKKILLQWIKSLKFPDGYVSNIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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