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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004317`

染色体: Chr03 坐标: 61528232-62709468 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004317`
名称	SmilChr03G004317
描述	probable glycosyltransferase At3g07620
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61528232 - 62709468 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015234`
GeneID	`131015234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015234`
原始查询	`LOC131015234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glycosyltransferase At3g07620
产物	probable glycosyltransferase At3g07620
Arabidopsis	`AT4G32790` (AT4G32790) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829415] identity=65.5; qcov=0.606; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0107700` - identity=57; qcov=0.538; evalue=1.15e-161; confidence=medium
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057799515.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799515.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799515.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799515.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62706720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B21,C16,C22,C41
`Chr3:62706770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr3:62707056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B130,B17,B53,B71
`Chr3:62707074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B76,B98
`Chr3:62707158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B129,B48,C56,C84
`Chr3:62707238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:62707363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr3:62707399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C76
`Chr3:62707588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B22,B88,C17,C24
`Chr3:62707593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C31
`Chr3:62708314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C39
`Chr3:62708380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799515.1

708 aa

354

708

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 374-659 aa

XP_057799516.1

708 aa

354

708

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 374-659 aa

XP_057799517.1

708 aa

354

708

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 374-659 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799515.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	374	659	1.2e-67	229.0	Exostosin GT47 domain
`XP_057799516.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	374	659	1.2e-67	229.0	Exostosin GT47 domain
`XP_057799517.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	374	659	1.2e-67	229.0	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943534.1
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGATCGGTCAAAGTCATGTTAGATGTTAGTAGTTAGTTCCCCATCCACTCCAAGAATCACCTTATCTCTCCATTCACCAAACTCCACCTTATATCTCCAATCACCAATTCGTTCCCAAGAGGGATCGAACCCGGGTACATTAATGGGTTTATTTGTTTATGTGATTATTGAAATTGTGTTTGGATGTTTATTGTTTATTGTTTGTTGTGTTTGTTGGAATCCCATCTCAAATTTGGTAA...

XM_057943533.1
GACTAAATGAAAGGGGGAAAATGAGCAGAAGAGAAAAAGTGTCTTATTATAGCATTCTTTTTTGTTTTCTTTCACCAACTGCTGAAGCAACCGGAAAATTAAAAAAAACCCATTGAAAAAGAAGCGAACTTGGATCGAATACATGAGCAGTTGACACATATCAAGCAGGGTTAAGTGTAAGCATGGGCAACGAGCTTCGCTATGTATGCCTCGTGGAGACGAGGAGGCTGCTGCTACTAATGGGGGTGGTTTTCGGGTTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131015234
ATGGGCAACGAGCTTCGCTATGTATGCCTCGTGGAGACGAGGAGGCTGCTGCTACTAATGGGGGTGGTTTTCGGGTTGGTTTTGTTTGTACAGTATTTCGAGCTTCCATATAGGAGTGTCTTATCCTGGACTAGCAAATCTCGAGTAGCTATTATTGAGAGTGATTACAGTAGGGATTCGTTTAGTAGAAGTTCTATGGATAGGGTGCCGACTGCCATTAAGGAAACGGATGGTGATACGAGAAATGGTAGAGATGAGTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057799515.1
MGNELRYVCLVETRRLLLLMGVVFGLVLFVQYFELPYRSVLSWTSKSRVAIIESDYSRDSFSRSSMDRVPTAIKETDGDTRNGRDEFVVNDTLGDGFGLENGKALNDTFGDDFALESGKTMNDTTLGDDFRLENGLNNTLGDDLGLENGLNDTLGDDFRVGDGKAFLNGTLDDDGIDPEDEIPFKDSLEKDRDSTIDTAVRNDIESTDDGLQELEEASRSSDSMRHDVVGDVIQTSVGESPSSLLSDAVPPQNPEPSRNA...

XP_057799516.1
MGNELRYVCLVETRRLLLLMGVVFGLVLFVQYFELPYRSVLSWTSKSRVAIIESDYSRDSFSRSSMDRVPTAIKETDGDTRNGRDEFVVNDTLGDGFGLENGKALNDTFGDDFALESGKTMNDTTLGDDFRLENGLNNTLGDDLGLENGLNDTLGDDFRVGDGKAFLNGTLDDDGIDPEDEIPFKDSLEKDRDSTIDTAVRNDIESTDDGLQELEEASRSSDSMRHDVVGDVIQTSVGESPSSLLSDAVPPQNPEPSRNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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