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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004448`

染色体: Chr03 坐标: 62618829-62622121 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004448`
名称	SmilChr03G004448
描述	L-gulonolactone oxidase 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62618829 - 62622121 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015247`
GeneID	`131015247`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015247`
原始查询	`LOC131015247`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-gulonolactone oxidase 3
产物	L-gulonolactone oxidase 3
Arabidopsis	`AT5G11540` (GulLO3) D-arabinono-1,4-lactone oxidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831026] identity=62; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0687800` - identity=61; qcov=0.926; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003885 (D-arabinono-1,4-lactone oxidase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01565 (FAD_binding_4); PF04030 (ALO); PF22906 (GULLO2-like_3rd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015247

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057799535.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057799535.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057799535.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799535.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62619126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B22
`Chr3:62619146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B128
`Chr3:62619186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:62619321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C87
`Chr3:62619333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:62619372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:62619386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B136,B82,D9
`Chr3:62619468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr3:62619535`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B123,B36,B95,C34,C81
`Chr3:62619535`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B123,B36,B95,C34,C81
`Chr3:62619536`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B123,B36,B95,C34,C81
`Chr3:62619536`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B123,B36,B95,C34,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799535.1

592 aa

296

592

FAD_binding_4

ALO

GULLO2-like_3rd

PF01565 FAD_binding_4 71-199 aa PF04030 ALO 440-532 aa PF22906 GULLO2-like_3rd 548-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799535.1`	Pfam	`PF01565`	FAD_binding_4	Domain	71	199	8.2e-21	74.9	FAD binding domain
`XP_057799535.1`	Pfam	`PF04030`	ALO	Family	440	532	1.3e-12	48.7	D-arabinono-1,4-lactone oxidase
`XP_057799535.1`	Pfam	`PF22906`	GULLO2-like_3rd	Domain	548	586	6.2e-22	77.7	L-gulonolactone oxidase 2-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943552.1
CCAAATAAATGGATAATCAATAAAGCTAGACATGCTTGCCGTTCAATTCAAGCATAACCATTTTAAATTTTGTGACAAATTAAACTTCCCTTCAAACTAGGGCAAAAAAATCCCTTTTATATACAGACCTTCAAGAAATCAAACACATGCCTCAAAAATAAAAATGAGCAAAATTTCCCAATTTTCAATCAAAAATCATCCTCCAAAAATGTCAATTGCCAATTTCTATTTTCAATCCATAATTTTGGGAATATTCGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015247
ATGAGCAAAATTTCCCAATTTTCAATCAAAAATCATCCTCCAAAAATGTCAATTGCCAATTTCTATTTTCAATCCATAATTTTGGGAATATTCGCTTCAGCCCTAACCGGAGCCATGCCGCCGCAGAACCCGGTCCAATGCACCCAAACCGGCTGCACGCTGTCCAACTCCTACGGCGTTTGGGGCGACCGGCAGCCCTGCCACGTCACCGCCGCCGTCTACCCGACCACCGAGGAGGAGCTGCGCTCCGCCGTGGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799535.1
MSKISQFSIKNHPPKMSIANFYFQSIILGIFASALTGAMPPQNPVQCTQTGCTLSNSYGVWGDRQPCHVTAAVYPTTEEELRSAVADASRRKLKVKAVSKFSHTIPKLACGSTILISTERYNSSIAVDRAKSTVTADAGVGLRELIDRAAEEGLSLAAAPYWEGVSVGGAISTGAHGSSWRGRGGALHDHVVGIRMVVAAKESEGFAKVVDLRESDELFNAAKVSLGLLGVISKVTFSLEPAFKRSITFNFTSDVGIEEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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