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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004331`

染色体: Chr03 坐标: 61669135-61676778 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004331`
名称	SmilChr03G004331
描述	cyclin-A2-1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61669135 - 61676778 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015256`
GeneID	`131015256`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015256`
原始查询	`LOC131015256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-A2-1-like
产物	cyclin-A2-1-like
Arabidopsis	`AT5G25380` (CYCA2;1) cyclin a2;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832610] identity=52.5; qcov=0.975; evalue=1.52e-156; confidence=high
Rice	`Os12g0502300` (CycA2) - identity=50.3; qcov=1; evalue=1.11e-149; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF02984 (Cyclin_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015256

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799552.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057799552.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057799552.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057799552.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61670587`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:61670587`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:61670600`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A25,B125,B35,B4,B87,B89,C63,C77,C79,C83,D1
`Chr3:61670602`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A25,B125,B35,B4,B87,B89,C63,C77,C79,C83,D1
`Chr3:61670620`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	B1,B114,B117,B18,B31,B63,B69,B7,B74,B9,B97,C15,C54,C60,C63,C67,C86,D1
`Chr3:61670680`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:61670919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B89,C63,C79
`Chr3:61671029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:61671102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:61671127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61671163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C31,C74,C78
`Chr3:61671632`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A7,B13,B134,B62,C2,C45,C51,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799552.1

486 aa

243

486

Cyclin_N

Cyclin_C

PF00134 Cyclin_N 227-354 aa PF02984 Cyclin_C 356-478 aa

XP_057799553.1

486 aa

243

486

Cyclin_N

Cyclin_C

PF00134 Cyclin_N 227-354 aa PF02984 Cyclin_C 356-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799552.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	227	354	4.1e-46	156.5	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057799552.1`	Pfam	`PF02984`	Cyclin_C	Domain	356	478	2.2e-36	125.2	Cyclin, C-terminal domain
`XP_057799553.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	227	354	4.1e-46	156.5	Cyclin, N-terminal domain
`XP_057799553.1`	Pfam	`PF02984`	Cyclin_C	Domain	356	478	2.2e-36	125.2	Cyclin, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943569.1
GCTCCGCTCCTCAGTATAAATACTCTCACACACACTACACACACTTCTCCCTTTCTCACCCCACACTCACTCAACAAGCTCACTAAACCTATACACACACTTTATCTTTCTGTATCGACGCATTTCGTTTGATGATCGATCTGCTCGATTCGAGGGCATAGCGCTGCTCTCAGAGCTCAGTAGCTGCAGTAGTGAGCTCGGTCCTCCGATTTTCTGCCAATCATGAAGGCATGCTAATTTGGTTCCACAAACACTTATTC...

XM_057943570.1
CACACACTTCTCCCTTTCTCACCCCACACTCACTCAACAAGCTCACTAAACCTATACACACACTTTATCTTTCTGTATCGACGCATTTCGTTTGATGATCGATCTGCTCGATTCGAGGGCATAGCGCTGCTCTCAGAGCTCAGTAGCTGCAGTACAATCATGAAGGCATGCTAATTTGGTTCCACAAACACTTATTCAATGAAGCATGCAGTCATGAATGATGAGAATAGGCCATCCAACCTTGGGGAGCCTACTGCAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015256
ATGAAGCATGCAGTCATGAATGATGAGAATAGGCCATCCAACCTTGGGGAGCCTACTGCAAGAGTCACAAGAGCACGGGCAAAATTCTTAGGCTCATCAAATGGATTGCCACCTCTATATCCTTCAACAAAACAAGATGACAAACGGGTCTCACGAGCAAGCTTGAAAAGAGCTGCACCTGACAAACCAGCAGGGAGTTCAGCTGCTTGTCACCCGCGTAAGAAAAGGGCTGTTCTTAAGGATGTAACTAATATCAACTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799552.1
MKHAVMNDENRPSNLGEPTARVTRARAKFLGSSNGLPPLYPSTKQDDKRVSRASLKRAAPDKPAGSSAACHPRKKRAVLKDVTNINCENLYINCINAAKGQPIRQDRKGSLQKKGKVESACYAKNSKVLGVKEENIVDEIHQVEAEGSQDTCPAEDLPTEPTELKNEEMSAAAGPVPLKIDSIKSWGPSDRDEVVLCMKQENLEDRGVIDIDSKHRDPQMCSLYAADIYTSLFARQVDRKPSPDYMENLQRDITQRMRSI...

XP_057799553.1
MKHAVMNDENRPSNLGEPTARVTRARAKFLGSSNGLPPLYPSTKQDDKRVSRASLKRAAPDKPAGSSAACHPRKKRAVLKDVTNINCENLYINCINAAKGQPIRQDRKGSLQKKGKVESACYAKNSKVLGVKEENIVDEIHQVEAEGSQDTCPAEDLPTEPTELKNEEMSAAAGPVPLKIDSIKSWGPSDRDEVVLCMKQENLEDRGVIDIDSKHRDPQMCSLYAADIYTSLFARQVDRKPSPDYMENLQRDITQRMRSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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