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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004454`

染色体: Chr03 坐标: 62654128-62655552 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004454`
名称	SmilChr03G004454
描述	protein JINGUBANG-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62654128 - 62655552 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015261`
GeneID	`131015261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015261`
原始查询	`LOC131015261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein JINGUBANG-like
产物	protein JINGUBANG-like
Arabidopsis	`AT2G26490` (AT2G26490) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817190] identity=38.1; qcov=0.921; evalue=4.81e-90; confidence=medium
Rice	`Os01g0232200` (OsWD40-10) - identity=51.1; qcov=0.779; evalue=1.17e-122; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799558.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799558.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799558.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799558.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799558.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62654156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:62654279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:62654419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C33,C57,C65
`Chr3:62654450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr3:62654540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:62654651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:62654753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,C1,C33,C57,C65
`Chr3:62654861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:62654864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:62654876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B13,B55
`Chr3:62654933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr3:62655110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C57,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799558.1

467 aa

234

467

WD40

PF00400 WD40 197-226 aa PF00400 WD40 231-268 aa PF00400 WD40 282-319 aa PF00400 WD40 333-363 aa PF00400 WD40 373-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799558.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	197	226	2.5e-34	116.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057799558.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	231	268	2.5e-34	116.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057799558.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	282	319	2.5e-34	116.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057799558.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	333	363	2.5e-34	116.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057799558.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	373	416	2.5e-34	116.9	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943575.1
CAATGGAACGCTACCCCACTCGAACTCCTCCACACCCATGCAACAACACCAACTTGTACGACGACGGCGGCGACACCAACCCCCACCAATCCCCGCCGCGCGCCTCCTTCAAGTCCGCCGCCCACCTCTACGAGAACCTCCTCTACAGCCCGCCGCGGTCGTCCTCCGCGGCGGCCAGCCCCAACTTCTACTCCCTCCTCCCGCCGCCGAGCCCCGACTCCCCTTGGAGCCTCTCCCCCCACCAGACCCCCTCCCCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015261
ATGGAACGCTACCCCACTCGAACTCCTCCACACCCATGCAACAACACCAACTTGTACGACGACGGCGGCGACACCAACCCCCACCAATCCCCGCCGCGCGCCTCCTTCAAGTCCGCCGCCCACCTCTACGAGAACCTCCTCTACAGCCCGCCGCGGTCGTCCTCCGCGGCGGCCAGCCCCAACTTCTACTCCCTCCTCCCGCCGCCGAGCCCCGACTCCCCTTGGAGCCTCTCCCCCCACCAGACCCCCTCCCCCGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799558.1
MERYPTRTPPHPCNNTNLYDDGGDTNPHQSPPRASFKSAAHLYENLLYSPPRSSSAAASPNFYSLLPPPSPDSPWSLSPHQTPSPALLYHCIASLHRQDGTIFSIAATKGLVFTGSESPRVRAWRQPDCAERGSFKAAEGEVRAVLAHGSTLFTSHRDRRVRAWTISAENNSFHVKKTATFPKSKSLFSFTRNPNPRHRDNISCMAYNHSEGLLYTASWDRTVKAWRVADGRCVDSFAAHEDQVNAVVVNQDDGCVFTCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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