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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004326`

染色体: Chr03 坐标: 61616270-61618589 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004326`
名称	SmilChr03G004326
描述	gibberellin 3-beta-dioxygenase 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61616270 - 61618589 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015264`
GeneID	`131015264`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015264`
原始查询	`LOC131015264`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gibberellin 3-beta-dioxygenase 1-like
产物	gibberellin 3-beta-dioxygenase 1-like
Arabidopsis	`AT1G15550` (GA3OX1) gibberellin 3-oxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838125] identity=46.4; qcov=1.03; evalue=1.53e-111; confidence=high
Rice	`Os01g0177400` (D18) - identity=39.1; qcov=1.01; evalue=5.41e-73; confidence=medium
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0009686 (gibberellin biosynthetic process); GO:0016707 (gibberellin 3-beta-dioxygenase activity)
KEGG	smil00904 (Diterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015264

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799563.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799563.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057799563.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799563.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61616438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:61616471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B100,B124,B53
`Chr3:61616484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C44
`Chr3:61616486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:61616497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B118
`Chr3:61616510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B104,B65,C52,D3
`Chr3:61616627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:61616638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:61616645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr3:61616683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:61616822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,D5
`Chr3:61618063`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799563.1

346 aa

173

346

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 51-152 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 204-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799563.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	51	152	4.1e-18	66.9	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057799563.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	204	303	6.8e-31	107.3	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943580.1
TTTTTCTTCCCTCTATAAAAATTCCCAACACAAAAATAGGAGACACAAAAAGGTTTCACATTTCAAACCCCCCTCTAAAGCCAAGAAGCAAGAAAACCCTCACCAAAATGGCAACATCCCTTTCACACGCCTACAAAGACACCCACATCCAACTCTCCCACATTATCCCACTCGATTTCGGGTCAGTCCGCCACCTCCCCGACTCCCACGTGTGGAGCGCCGCCCACGAGGCCCCCGCACGTGCGGAGGGGGCGGCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015264
ATGGCAACATCCCTTTCACACGCCTACAAAGACACCCACATCCAACTCTCCCACATTATCCCACTCGATTTCGGGTCAGTCCGCCACCTCCCCGACTCCCACGTGTGGAGCGCCGCCCACGAGGCCCCCGCACGTGCGGAGGGGGCGGCCCTTCCCGTGATCGACCTGCGGGCCCCGGACGCGGCGGGGCTCGTGGGGGAGGCGTGCCGGGGGTGGGGGGTGTTCCAGGTCACGAACCACGAGGTCCCCGAGGCCCTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799563.1
MATSLSHAYKDTHIQLSHIIPLDFGSVRHLPDSHVWSAAHEAPARAEGAALPVIDLRAPDAAGLVGEACRGWGVFQVTNHEVPEALVEEVEGHARRLFGLPAERKARALRTPSGATGYGVARISPFFPKLMWHEGFTIMGGSAVEHAKQLWPHHYHHFCDAMDKYQKKMKSVAYKILLLILKALGVDEEELISSSSSFLMYQSDGALQLNSYPSCPNPSRAIGLAPHTDSLLLTILHQNDTDGLQILQEGVGWVRIPPIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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