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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004445`

染色体: Chr03 坐标: 62583977-62587883 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004445`
名称	SmilChr03G004445
描述	uncharacterized SmilChr03G004445
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62583977 - 62587883 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015269`
GeneID	`131015269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015269`
原始查询	`LOC131015269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsPOP11; symbol=OsPOP11; hit=Os06g0163200; species=rice; confidence=high
产物	OsPOP11; symbol=OsPOP11; hit=Os06g0163200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G25770` (AT5G25770) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832646] identity=63.1; qcov=0.822; evalue=1.52e-167; confidence=high
Rice	`Os06g0163200` (OsPOP11) - identity=65.9; qcov=0.848; evalue=2.03e-178; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00326 (Peptidase_S9); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799570.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057799570.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057799570.1`
4	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057799570.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62584140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62584187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B13,B55,C30
`Chr3:62585232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B104,B35,C4
`Chr3:62585369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B33
`Chr3:62585477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:62585502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62585506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:62585507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:62585685`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr3:62585685`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr3:62585821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62585835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799570.1

422 aa

211

422

Abhydrolase_6

Peptidase_S9

PF12697 Abhydrolase_6 169-402 aa PF00326 Peptidase_S9 191-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799570.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	169	402	1.2e-07	33.3	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057799570.1`	Pfam	`PF00326`	Peptidase_S9	Domain	191	287	6.4e-09	36.4	Prolyl oligopeptidase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943587.1
AATTTTTTTTTAAAAAATTGTCTAAGTAAGTTAAGAATGAGAGAAAAGAGAAGGATGGATGGTTTAATACTCTTATCCGTAGTAATGGCTGCTGTAGTGTCGCACGTGCCGAACGGCATCTCTCACGTGCGCGCCAATTCAGTGTTCACTGCCTGCGGCTATTATAAATCCAACTGCTACGCCAACTTGGCAGCTCACGCAATTGCTCCGCGATTCCTCTCGGCTCATAGGAGAATGGAGCAATCCGACGCCGCCGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015269
ATGAGAGAAAAGAGAAGGATGGATGGTTTAATACTCTTATCCGTAGTAATGGCTGCTGTAGTGTCGCACGTGCCGAACGGCATCTCTCACGTGCGCGCCAATTCAGTGTTCACTGCCTGCGGCTATTATAAATCCAACTGCTACGCCAACTTGGCAGCTCACGCAATTGCTCCGCGATTCCTCTCGGCTCATAGGAGAATGGAGCAATCCGACGCCGCCGCGAAGCTTCGCTCCGAGTTTCTGCAGGTCCTCCGCAGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799570.1
MREKRRMDGLILLSVVMAAVVSHVPNGISHVRANSVFTACGYYKSNCYANLAAHAIAPRFLSAHRRMEQSDAAAKLRSEFLQVLRSRRTAEVPLSVESAQPVRDPLYQETPTPTYSEAMESCPKKEIANFRELLQEENFYLTTEAGEQGRLPVLLLKLKESTPERRPAVVFLHSTHKNKEWLRPLLEAYASRNYIAIAIDSRYHGERAKNLTTYQDALVSSWKKGDTMPFIFDTVWDLIKLADHLTERQDIDPSRIGITG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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