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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004438`

染色体: Chr03 坐标: 62524101-62526501 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004438`
名称	SmilChr03G004438
描述	BURP domain protein RD22
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62524101 - 62526501 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015284`
GeneID	`131015284`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015284`
原始查询	`LOC131015284`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BURP domain protein RD22
产物	BURP domain protein RD22
Arabidopsis	`AT5G25610` (RD22) BURP domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832636] identity=47.3; qcov=1.16; evalue=7.58e-111; confidence=high
Rice	`Os01g0733500` (RD22) - identity=57.3; qcov=0.732; evalue=3.01e-92; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03181 (BURP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015284

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057799615.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799615.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799615.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799615.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799615.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62524812`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A14,B52,C2
`Chr3:62524812`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A14,B52,C2
`Chr3:62524845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:62525473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B71,C70
`Chr3:62525475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:62525508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:62525509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:62525511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C4
`Chr3:62525538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B32,D10
`Chr3:62525545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B24,C26
`Chr3:62525563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B78,C61
`Chr3:62525571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C18,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799615.1

339 aa

170

339

BURP

PF03181 BURP 128-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799615.1`	Pfam	`PF03181`	BURP	Family	128	336	3e-82	276.1	BURP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943632.1
GGACATTTAAATTTTCGCCCCCCCCCCCCCCCCCACCAAACTATTTAACCATTAATTATACTATAGTATAATCAGTCGATGCGTGACAGTGTATGTGCATAAATATAAAGAATATTTATATCGATAATAATTATAAATACATTTAAGTTTGCATTAAATTGTTTCGATTTAGAGAGGCTTGTGCCGTTGGGATTAAATTACTAGTCATGCTTTTAGGTGGTGACGTGGCGCAGTGATTTTTTTTTAATTTTATTTTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015284
ATGGAGTTCAAGATTCTGCCCTTCATTGCATTTCTCTCTGTGGCAATAGTTGTGAGCCATGCAGCTTTGCCTTCAGAGGAGTATTGGAATTCTGTGTTGCCAAACACTCCCATGCCTAAAGCTGTAAAAGAATTGCTGCAGCCAACATCTGAATGGCTGGAAGACAAGAGCACATCCGTCGGAGTAGGCGGCGGCGGAGTGAACGTCAACAACAATAACAACACCCACGTCAGCGTCGGCGGCAAAGGTGGCGGCGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799615.1
MEFKILPFIAFLSVAIVVSHAALPSEEYWNSVLPNTPMPKAVKELLQPTSEWLEDKSTSVGVGGGGVNVNNNNNTHVSVGGKGGGVTVGTHNRRGRPVYVRVAPGQSPFIYHYAATESQLHDDPNVALFFLEKDLYAGNKMNLHFSKPANVETFLPRHVADSIPFSSSKLPEIYSEFSVKPDSDEAEAIKKTIQECEDTELVGEERFCATSLESMVDFSTFVLGKDARAVSTEAESAEQKVYRIEAVTRMPSDKPVVVCH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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