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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004343`

染色体: Chr03 坐标: 61724727-61727470 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004343`
名称	SmilChr03G004343
描述	uncharacterized SmilChr03G004343
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	61724727 - 61727470 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015290`
GeneID	`131015290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015290`
原始查询	`LOC131015290`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	titan9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821546]; symbol=TTN9; hit=AT3G20070; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	titan9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821546]; symbol=TTN9; hit=AT3G20070; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G20070` (TTN9) titan9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821546] identity=42.2; qcov=0.997; evalue=6.11e-66; confidence=medium
Rice	`Os06g0245600` (RPL1) - identity=31.4; qcov=1.02; evalue=6.36e-28; confidence=low
GO	GO:0003006 (developmental process involved in reproduction)
KEGG	-
Pfam	PF25091 (DUF7806)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799621.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057799621.1`
3	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057799621.1`
4	PML body	PML body	0.20000	`XP_057799621.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057799621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:61724947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A5,B114,B69,B93
`Chr3:61725027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:61725029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:61725361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:61725421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B63,B82,D4
`Chr3:61725582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr3:61725747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B78
`Chr3:61725866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B63,B82,D4
`Chr3:61726425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B33,B76
`Chr3:61726580`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B4
`Chr3:61726580`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B4
`Chr3:61726846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B33,B76,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799621.1

297 aa

148

297

DUF7806

PF25091 DUF7806 203-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799621.1`	Pfam	`PF25091`	DUF7806	Domain	203	296	2.8e-41	140.3	Domain of unknown function (DUF7806)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943638.1
GATGAAGGTGCGACTGAAGTGATGGAAATGAAATTGAAAAAAAAATTCAAAAGCTTCTTGAGCCCTAATTCCCTTTCTCCCTCGTCTGCATCTTCAATTCCAGAGTTTGGGGAGAATTCAAGAAAAGATGGAAGCTCTTTACGCGAAGCTATACGACAAATACTCGAAACTGAAGAAGGAAAAGGAGTCCCAGTTTGATAAAGTGAACTATGAACAAGAAGTGAAATTCTTGAATTATGAAGCTGCTGCAGATGAGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015290
ATGGAAGCTCTTTACGCGAAGCTATACGACAAATACTCGAAACTGAAGAAGGAAAAGGAGTCCCAGTTTGATAAAGTGAACTATGAACAAGAAGTGAAATTCTTGAATTATGAAGCTGCTGCAGATGAGATGATCCAGTACTTGAAAAGTGAGAATGACAAGCTCCATGAACGTGTATATGATTTGAAAAATGAATTGGCTTCTATCAGAGCTTCCAGTGATGAACAACGTATTCACTTCCAAAAGTTGTTGGCAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799621.1
MEALYAKLYDKYSKLKKEKESQFDKVNYEQEVKFLNYEAAADEMIQYLKSENDKLHERVYDLKNELASIRASSDEQRIHFQKLLAEEKQKNKELCEEISRLQKVEHKECSSYTMPMENEQENVDNTPGEQMQGTSLAKSTKKRKFIHISEGTAAQYVDVEVDCPSGQLVSRDKNSGAPSMQQPACCQRMANSSGGDAADTSSFSCMFQYLVEFVVGLKVSPLIKSNEPSILAHHQSSGYSFSLTWITNSDGEVELLYRVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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