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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004453`

染色体: Chr03 坐标: 62649236-62651273 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004453`
名称	SmilChr03G004453
描述	aquaporin TIP4-1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62649236 - 62651273 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015295`
GeneID	`131015295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015295`
原始查询	`LOC131015295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin TIP4-1
产物	aquaporin TIP4-1
Arabidopsis	`AT2G25810` (TIP4;1) tonoplast intrinsic protein 4;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817123] identity=78; qcov=0.992; evalue=1.6e-125; confidence=high
Rice	`Os05g0231700` (OsTIP4) - identity=59.5; qcov=0.98; evalue=4.17e-90; confidence=high
GO	GO:0006833 (water transport); GO:0015250 (water channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057799627.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057799627.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057799627.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799627.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62649718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:62649757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:62649763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,B99,C40
`Chr3:62649806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:62649817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B125
`Chr3:62649859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:62650795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B24,C26,C52,D11
`Chr3:62650852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B24
`Chr3:62650867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:62650873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B32
`Chr3:62650885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:62650933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799627.1

247 aa

124

247

MIP

PF00230 MIP 14-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799627.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	14	228	8.8e-70	235.7	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943644.1
AATGTGTTTCAATGGAATCTTACTCATGAATATGCATGTTCATGCATGTGCATGCTCCTATAAATACACCAATTTGTGGGAAAGCCTATTGCCATTCATATGTAGCACCAATAATTCTACATTAATTTCTATATTTCCTCTCTAATTAATTCTCTAACTATTAATTAAATTTATTTTTGTGATGGCGAAGATCGCCGTCGGCAACGCCGCCGAGGCTTACCAGCCGGACACCCTCCAAGCCTTGGTGGTGGAGTTCATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015295
ATGGCGAAGATCGCCGTCGGCAACGCCGCCGAGGCTTACCAGCCGGACACCCTCCAAGCCTTGGTGGTGGAGTTCATCTGCACCTTCCTTTTCGTCTTTGCCGGCGTCGGCGCCGCCATGGCCACCGATAAGTTGAATGGGGACCCACTAGTGGGGCTGTTTTTTGTGGCGATGGCGCATGCTCTGGTGGTGGCGGTGATGATCTCCGCCGGTTTCCGCATCTCCGGCGGCCACCTCAACCCCGCCGTCACCCTCGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799627.1
MAKIAVGNAAEAYQPDTLQALVVEFICTFLFVFAGVGAAMATDKLNGDPLVGLFFVAMAHALVVAVMISAGFRISGGHLNPAVTLGLLVGGHITVVRSILYWIDQLLASVAACALLSYITGGMTTPIHSLASGVGAIQGIVMEIVLTFSLLFTVYATIVDPKKGNLEGLGPLLTGLVVGANIMAGGPFSGASMNPARSFGPALVSGNWTDHWIYWVGPLIGGGLAGFICENFFIVRTHVPLARDETF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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