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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004441`

染色体: Chr03 坐标: 62553715-62584049 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004441`
名称	SmilChr03G004441
描述	protein PEROXIN-4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	62553715 - 62584049 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015307`
GeneID	`131015307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015307`
原始查询	`LOC131015307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PEROXIN-4
产物	protein PEROXIN-4
Arabidopsis	`AT5G25760` (PEX4) peroxin4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832645] identity=94.9; qcov=1; evalue=1.55e-113; confidence=high
Rice	`Os02g0634800` (UBC) - identity=94.9; qcov=1; evalue=3.37e-114; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799645.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799645.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057799646.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799645.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:62583399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr3:62583439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B122,B24
`Chr3:62583487`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A14,A16,A22,B1,B11,B123,B130,B14,B18,B25,B31,B46,B48,B49,B53,B55,B59,B6,B61,B63,B69,B7,B73,B79,B87,B9,C19,C24,C47,C64,C66,C67,C75,C77,C83,C9,D3
`Chr3:62583497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	183	A10,A11,A13,A15,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B126,B127,B128,B13,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B22,B24,B27,B30,B32,B33,B36,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B51,B54,B55,B56,B58,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B73,B74,B76,B77,B78,B80,B81,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C72,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C84,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr3:62583514`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	B11,B119,B130,B25,B29,B46,B48,B49,B53,B55,B59,B65,B66,B69,B79,B84,B87,C19,C24,C45,C47,C77,C83,C9
`Chr3:62583738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B13,B55,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799645.1

159 aa

159

UQ_con

PF00179 UQ_con 7-135 aa

XP_057799646.1

157 aa

157

UQ_con

PF00179 UQ_con 7-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799645.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	7	135	2.3e-43	147.9	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057799646.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	7	146	4.9e-44	150.0	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943662.1
TGTTGAAGTAAGCTGAGCGCCTATTTTGTGATCACTCATCAATTCACTACGGTCTTCGGTGAGAATTGGTGTGAATTTGATAGCAAAAGTCAGTGTTGAAAATGCAGGCATCAAGGGCAAGGCTCTTTAAGGAATACAAAGAAGTACAGCGAGAGAAAACAGCTGATCCAGATATCCAACTCGTTTGTGACGATTCAAACATATTTAAATGGACTGCTCTTATAAAGGGGCCATCGGAAACTCCTTATGAGGGTGGAGTT...

XM_057943663.1
TGTTGAAGTAAGCTGAGCGCCTATTTTGTGATCACTCATCAATTCACTACGGTCTTCGGTGAGAATTGGTGTGAATTTGATAGCAAAAGTCAGTGTTGAAAATGCAGGCATCAAGGGCAAGGCTCTTTAAGGAATACAAAGAAGTACAGCGAGAGAAAACAGCTGATCCAGATATCCAACTCGTTTGTGACGATTCAAACATATTTAAATGGACTGCTCTTATAAAGGGGCCATCGGAAACTCCTTATGAGGGTGGAGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015307
ATGCAGGCATCAAGGGCAAGGCTCTTTAAGGAATACAAAGAAGTACAGCGAGAGAAAACAGCTGATCCAGATATCCAACTCGTTTGTGACGATTCAAACATATTTAAATGGACTGCTCTTATAAAGGGGCCATCGGAAACTCCTTATGAGGGTGGAGTTTTCCAGCTTGCTTTCTCCGTACCTGAGCAGTATCCTTTGCAGCCTCCTCAAGTTCGGTTCTTAACCAAAATATTCCATCCAAATGTGCATTTCAAGACAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799645.1
MQASRARLFKEYKEVQREKTADPDIQLVCDDSNIFKWTALIKGPSETPYEGGVFQLAFSVPEQYPLQPPQVRFLTKIFHPNVHFKTGEICLDILKNAWSPAWTLQSVCRAIIALMAHPEADSPLNCDSGNFFQDSFTNYPYGIFWGSLTAYQKTCQSWK

XP_057799646.1
MQASRARLFKEYKEVQREKTADPDIQLVCDDSNIFKWTALIKGPSETPYEGGVFQLAFSVPEQYPLQPPQVRFLTKIFHPNVHFKTGEICLDILKNAWSPAWTLQSVCRAIIALMAHPEADSPLNCDSGNLLRSGDIRGFQSMAKMYTRLAAMPKKG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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