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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004544`

染色体: Chr03 坐标: 63438922-63444677 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004544`
名称	SmilChr03G004544
描述	uncharacterized SmilChr03G004544
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63438922 - 63444677 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015339`
GeneID	`131015339`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015339`
原始查询	`LOC131015339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GTP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833993]; symbol=AT5G39960; hit=AT5G39960; species=arabidopsis; confidence=high
产物	GTP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833993]; symbol=AT5G39960; hit=AT5G39960; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G39960` (AT5G39960) GTP-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833993] identity=66.5; qcov=0.785; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0225200` - identity=63.4; qcov=0.199; evalue=2.22e-48; confidence=weak
GO	GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF01926 (MMR_HSR1); PF02421 (FeoB_N); PF14714 (KH_dom-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015339

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799688.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057799688.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057799688.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057799688.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63439160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,D3
`Chr3:63439212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr3:63439223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B24,B38,B78
`Chr3:63439257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B121,B136,B80,C18
`Chr3:63439293`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A15,A18,A25,A8,B100,B108,B118,B120,B130,B14,B140,B33,B5,B61,B66,B72,B87,C23,C41,C43,C49,C64,C66,C76,C9,D1,D3,D5
`Chr3:63439300`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A15,A18,A25,A8,B100,B108,B118,B120,B130,B14,B140,B33,B5,B61,B66,B72,B87,C23,C41,C43,C49,C64,C66,C76,C9,D1,D3,D5
`Chr3:63439663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B32,C59,C62
`Chr3:63439669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B79
`Chr3:63439682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B61
`Chr3:63439683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:63439702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B32,C59,C62
`Chr3:63439764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B85,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799688.1

673 aa

336

673

MMR_HSR1

FeoB_N

MMR_HSR1

GTP_EFTU

KH_dom-like

PF01926 MMR_HSR1 162-283 aa PF02421 FeoB_N 364-536 aa PF01926 MMR_HSR1 365-488 aa PF00009 GTP_EFTU 365-542 aa PF14714 KH_dom-like 548-627 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799688.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	162	283	2.3e-44	150.8	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057799688.1`	Pfam	`PF02421`	FeoB_N	Domain	364	536	2.5e-17	63.5	Ferrous iron transport protein B
`XP_057799688.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	365	488	2.3e-44	150.8	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057799688.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	365	542	2.6e-16	60.5	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057799688.1`	Pfam	`PF14714`	KH_dom-like	Domain	548	627	2e-21	76.8	KH-domain-like of EngA bacterial GTPase enzymes, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943705.1
TTGCTGATGGTTAACTTTAGAATGAACTAGTTTAAACCCTAAATTGGAATTTCTGTCTTAAACCCCATTTCACCTCACCGACTACGTGTTCCGGCAAAGGTATATTTCCTTCAGCTTATCCAGCAGCATCGAGCATCAGAAAATGCCAGAGGAAATCTGGGCGCAGTGAGAGAGTGGCCGCAAATATATGCGGATTACACCACTTAGTTTTGAAAATGAGGGGATCATGGTTTCGGGCCGTCTCGGGCCGAAAAAGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015339
ATGAGGGGATCATGGTTTCGGGCCGTCTCGGGCCGAAAAAGCCGCCATGCCCTTGATGGTCTATGCTCGAGAAACGCCCCCTTACAGTATACAATGCGTAACCTAATTTCCAAATTCTTGGGTAATGTCGAAAGAAAGTTCTTAAATGCTACCGCTGAAGTAAAATTAAAGCGTGGGTGTTGTTATGCGGTGTGCGGCATAGGAGTGGCGCCTTGCAAATCCGTTAATGGGCCATCGCTCTTGGCTCTGTGCTCTTATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799688.1
MRGSWFRAVSGRKSRHALDGLCSRNAPLQYTMRNLISKFLGNVERKFLNATAEVKLKRGCCYAVCGIGVAPCKSVNGPSLLALCSYLTRNAVNFCSMPEHEVGIESMGSVVSPPLGDSSSEVKEEVRVAADYSDFDEPKSKARAITRESIDFTKIPIEKLPTVLIIGRPNVGKSALFNRLIRRREALVYNTPNDHVTRDIRDGIAKLGDLRFRVLDSAGLEAEASSGSVLGRTAAMTGYVLSKAHLSLFLIDARDGLQPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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