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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004552`

染色体: Chr03 坐标: 63482446-63488364 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004552`
名称	SmilChr03G004552
描述	endoribonuclease YBEY, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63482446 - 63488364 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015353`
GeneID	`131015353`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015353`
原始查询	`LOC131015353`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoribonuclease YBEY, chloroplastic
产物	endoribonuclease YBEY%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G25870` (AT2G25870) haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817128] identity=74.5; qcov=0.82; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0739400` - identity=60; qcov=0.796; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0006364 (rRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF00702 (Hydrolase); PF02130 (YbeY); PF05116 (S6PP); PF08282 (Hydrolase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015353

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799710.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057799710.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057799710.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057799710.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799710.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63482559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:63482567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:63482581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:63482834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B83,C22,C77,D9
`Chr3:63484152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr3:63484153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:63484178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B50,C8
`Chr3:63485176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:63485409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B140,B95
`Chr3:63485556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:63485584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr3:63486220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799710.1

593 aa

296

593

YbeY

Hydrolase_3

Hydrolase

S6PP

PF02130 YbeY 161-280 aa PF08282 Hydrolase_3 324-588 aa PF00702 Hydrolase 494-555 aa PF05116 S6PP 499-567 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799710.1`	Pfam	`PF02130`	YbeY	Domain	161	280	8.4e-35	120.5	Endoribonuclease YbeY
`XP_057799710.1`	Pfam	`PF08282`	Hydrolase_3	Domain	324	588	2.2e-52	179.1	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057799710.1`	Pfam	`PF00702`	Hydrolase	Domain	494	555	2.4e-14	54.9	haloacid dehalogenase-like hydrolase
`XP_057799710.1`	Pfam	`PF05116`	S6PP	Family	499	567	1.5e-15	58.2	Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943727.1
TTGATAAAACCGTCGACTGAACTGAATGCTCTCTCGCCTCTCTCCTCTCCTCCGCGCCGCACCTCTCCCCCCACCTTCTTCAATGGCGGCGCGCGTCATCTCACGCATGCTCCCCTCCATTGCCGCCATGCCTTCGAGGCTCACGCATCTGCCGCCTCATCGCCGCTTCTACGCGCTGGCGTCGTACTCGGAGGTCGCATCTATTTCCGGAAGGAGGATATTTGTCAGTGATAGTGGCTCGCGTAACTCGCGGTTCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015353
ATGCTCTCTCGCCTCTCTCCTCTCCTCCGCGCCGCACCTCTCCCCCCACCTTCTTCAATGGCGGCGCGCGTCATCTCACGCATGCTCCCCTCCATTGCCGCCATGCCTTCGAGGCTCACGCATCTGCCGCCTCATCGCCGCTTCTACGCGCTGGCGTCGTACTCGGAGGTCGCATCTATTTCCGGAAGGAGGATATTTGTCAGTGATAGTGGCTCGCGTAACTCGCGGTTCGGCGGCAGAAATGGAGGTGTTGTCGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799710.1
MLSRLSPLLRAAPLPPPSSMAARVISRMLPSIAAMPSRLTHLPPHRRFYALASYSEVASISGRRIFVSDSGSRNSRFGGRNGGVVVAEGRREYRKVRSRRVAAAKRSKEKQLELSVKICLEEQLPEDPEIVDITEIMRLNVPMAMKLAFERLNDSQYTTRDAVITDVGCYESVELSVLFCNDEFIQKLNKDWRGEDHATDVLSMSQHIPELKLPILMLGDIVISVETAARQAEERGHTLIDEIRILMVHGLLHLLGFDHE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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