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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004574`

染色体: Chr03 坐标: 63634476-63641250 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004574`
名称	SmilChr03G004574
描述	vacuolar-processing enzyme-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63634476 - 63641250 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015365`
GeneID	`131015365`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015365`
原始查询	`LOC131015365`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar-processing enzyme-like
产物	vacuolar-processing enzyme-like
Arabidopsis	`AT4G32940` (GAMMA-VPE) gamma vacuolar processing enzyme [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829431] identity=72.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0559600` (OsVPE2) - identity=71; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0006624 (vacuolar protein processing); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01650 (Peptidase_C13); PF20985 (Legum_prodom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015365

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057799725.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057799724.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.40000	`XP_057799725.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057799724.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63634874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B32
`Chr3:63634889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:63635109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:63635163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:63635280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B35,B55
`Chr3:63635292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr3:63635528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:63635546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B75,B88,C59,C86
`Chr3:63635547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B75,B88,C59,C86
`Chr3:63636114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B122,B35,B55
`Chr3:63636117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B50,B56,C37
`Chr3:63636120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799724.1

535 aa

268

535

Peptidase_C13

Legum_prodom

PF01650 Peptidase_C13 100-371 aa PF20985 Legum_prodom 423-518 aa

XP_057799725.1

395 aa

198

395

Peptidase_C13

Legum_prodom

PF01650 Peptidase_C13 1-231 aa PF20985 Legum_prodom 283-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799724.1`	Pfam	`PF01650`	Peptidase_C13	Domain	100	371	4.5e-114	381.1	Peptidase C13 family
`XP_057799724.1`	Pfam	`PF20985`	Legum_prodom	Domain	423	518	8.7e-42	142.0	Legumain, prodomain
`XP_057799725.1`	Pfam	`PF01650`	Peptidase_C13	Domain	1	231	6.1e-89	298.7	Peptidase C13 family
`XP_057799725.1`	Pfam	`PF20985`	Legum_prodom	Domain	283	378	5.3e-42	142.7	Legumain, prodomain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943741.1
GTGGTCTTGGATGTCCGAGTTTCTAATTTGGTTATGCGACATTGTACTTTCTGATTTGCATTAATAATATTGCTCATTTTTGCTTAAAAAAAATAATTGCTTAAAAAATTCAAATATGAAATATCTATGGAGCCCCACGACTCTAACTAAAACCAACCAACTTTTGATAGCAATGTACACATGAGATTAATTAATTGTAAAAGACAAACCCTCAACTAGAATTAGAAACACAAACCAAAACGTTAGCTTTAATACGTCAT...

XM_057943742.1
GAGTGAAATTGCAAAAGGTTACATGCTGACGTATGCCACGCGTATCAAATCTTGAAGAGAGGCGGTCTGAAGGATGAAAACATTGTAGTTTTCATGTATGATGACATTGCCTACAACAGAGAGAACCCCCGGCCCGGTGTCATCATCAACAACCCGTATGGTGAGGACGTTTACGAGGGAGTGCCAAAGGATTATGTTGGAAACGCGGTAACTGCTGAAAACTTGTACGCCGTGATTCTTGGCGACAAAACTGCACTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015365
ATGCATTTAGGTGATCTGGTGGGAGTGCTCTTAGTCACACGTAACTACACTCTCCTCTCCTTTATATACGCTAAGTTTAGATCCTTCAACACACCCCGAATTCCACTCAACACTAATTATATTCCTTCAACTCCGGAGATAATGATACGCTACGCCGCCGGTGCACTCCTCCTCCTTGCACTCTCGATCCTGACCGTTGCCGACGGCCGCCGCGATCTCATCAAGCTGCCGACGGAAGCTCGCCGCTTCTTCGCCGCGGA...

LOC131015365
ATGTATGATGACATTGCCTACAACAGAGAGAACCCCCGGCCCGGTGTCATCATCAACAACCCGTATGGTGAGGACGTTTACGAGGGAGTGCCAAAGGATTATGTTGGAAACGCGGTAACTGCTGAAAACTTGTACGCCGTGATTCTTGGCGACAAAACTGCACTGAAGGGAGGCAGTGGAAAGGTTGTGGATAGCGGTCCGAATGATCACATCTTCATATATTACACAGACCATGGTGGTCCCGGAATTCTTGGAACTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799724.1
MHLGDLVGVLLVTRNYTLLSFIYAKFRSFNTPRIPLNTNYIPSTPEIMIRYAAGALLLLALSILTVADGRRDLIKLPTEARRFFAADRDAGADEDSVGTRWAVLFAGSSGYWNYRHQADVCHAYQILKRGGLKDENIVVFMYDDIAYNRENPRPGVIINNPYGEDVYEGVPKDYVGNAVTAENLYAVILGDKTALKGGSGKVVDSGPNDHIFIYYTDHGGPGILGTPAGPYIYADDLNAVLKQKHAAGTYKSLVFYLEAC...

XP_057799725.1
MYDDIAYNRENPRPGVIINNPYGEDVYEGVPKDYVGNAVTAENLYAVILGDKTALKGGSGKVVDSGPNDHIFIYYTDHGGPGILGTPAGPYIYADDLNAVLKQKHAAGTYKSLVFYLEACEAGTIFDGLLPEGLNIYATTASNTVESSWGTYCPGEYPSPPRGYDTCLGDLYSIAWMEDSDVHNLRTETLKQQYELVKKRTLNDNGYYGSHVMQYGDVQLNAETLFLYMGTDPANDNFTFAEENSLFPSSQVVNQRDADL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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