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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004633`

染色体: Chr03 坐标: 63963608-63965703 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004633`
名称	SmilChr03G004633
描述	protein ANTAGONIST OF LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63963608 - 63965703 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015370`
GeneID	`131015370`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015370`
原始查询	`LOC131015370`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ANTAGONIST OF LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1
产物	protein ANTAGONIST OF LIKE HETEROCHROMATIN PROTEIN 1
Arabidopsis	`AT5G12010` (AT5G12010) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831074] identity=61.2; qcov=0.964; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0582600` (B1097D05.32) - identity=61; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015370

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799733.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799733.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799733.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799733.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799733.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63964064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C37
`Chr3:63964303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr3:63964354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B37,C32,C68
`Chr3:63964366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:63964376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B28
`Chr3:63964377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:63964378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B19
`Chr3:63964395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C8
`Chr3:63964471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr3:63964476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B15,B18,C7
`Chr3:63964483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:63964522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C5,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799733.1

500 aa

250

500

DDE_Tnp_4

PF13359 DDE_Tnp_4 288-444 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799733.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	288	444	4.6e-33	114.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943750.1
ATTAAAACCACAAATAATAATTTCCTAAAGAAAAAAAAACCAAGATAATTATCAACAAAACAAAAAAGACCGCGTATTCTCATTTCCCATCTCTCTACCAAGTCACCGTCTCTACCCCCCCCCCCCCCCCTCCACCCACCCACCCACCCACCCACCTATTACTTCTCTACGAAACTTCTCAATTGCCGACGCTGCGTTCACACCTCTCCCACACGTTTTCTCTCTCTCTCCCTCTCTTCATTTCTCTCTCTATATCGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015370
ATGATCGAAAACAAGCTCCTCCAGCAGCGGAAGCGCCGCAAAACAGACGCCGCGATCCACGGCGGCGCCGCCGCCGATCCCAAGCACCAAATGAAGACCAAAGGCCTGAGCGAGATCATCACCTCCCTCCTCCTCTTCGACGACCACGAGAAGCACGAGCTCGACGAGATCGACAAATCCGATCACGACGAGAAGCTCCAATTCGAGCAGAATCACATCAGCAAGCGCCGCGCCATGGCGGATTACTACTCCAGCCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799733.1
MIENKLLQQRKRRKTDAAIHGGAAADPKHQMKTKGLSEIITSLLLFDDHEKHELDEIDKSDHDEKLQFEQNHISKRRAMADYYSSLQSSHEDSERIESARKRKSKAANAAFASAAAEAVEKSFSTASAVTDDKEKEKDEKTATPGPQRRLWVKNRSKDWWDQCSGPDFPDAEFKKAFRMGKQTFEMICSELTAVVAKENTMLRDAVPVRQRVAVCIWRLATGEPLRLVSKKFGLGISTCHKLVLEVCSAIRNVLMPKYLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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