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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004614`

染色体: Chr03 坐标: 63851854-63854722 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004614`
名称	SmilChr03G004614
描述	protein indeterminate-domain 12-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63851854 - 63854722 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015381`
GeneID	`131015381`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015381`
原始查询	`LOC131015381`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein indeterminate-domain 12-like
产物	protein indeterminate-domain 12-like
Arabidopsis	`AT1G55110` (IDD7) indeterminate(ID)-domain 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841954] identity=57.7; qcov=0.713; evalue=1.76e-118; confidence=high
Rice	`Os01g0195000` (OsIDD2) - identity=76.1; qcov=0.45; evalue=4.62e-114; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF00096 (zf-C2H2); PF22992 (C2CH-4th_BIRD-IDD); PF22995 (C2CH-3rd_BIRD-IDD); PF22996 (C2H2-2nd_BIRD-IDD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015381

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799744.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799744.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799744.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799744.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799744.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63852040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B37,B84,C20
`Chr3:63852172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:63852186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C46
`Chr3:63852283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B104
`Chr3:63852308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr3:63852397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:63852481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B84,C16
`Chr3:63852538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:63852559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,C61,C76
`Chr3:63852604`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	93	A13,A15,A22,A3,A4,A5,A8,A9,B101,B103,B105,B106,B107,B108,B11,B114,B117,B122,B123,B13,B133,B138,B140,B15,B17,B18,B2,B24,B26,B27,B3,B30,B36,B37,B42,B43,B45,B46,B52,B56,B59,B6,B64,B65,B68,B7,B72,B76,B77,B78,B81,B82,B85,B88,B89,B93,B94,B96,C1,C11,C13,C15,C17,C18,C2,C20,C21,C24,C28,C31,C33,C35,C4,C46,C48,C57,C59,C69,C7,C72,C74,C78,C8,C81,C82,C83,C86,C9,D1,D11,D4,D7,D9
`Chr3:63852631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:63853411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799744.1

464 aa

232

464

zf-C2H2

C2H2-2nd_BIRD-IDD

C2CH-3rd_BIRD-IDD

C2CH-4th_BIRD-IDD

PF00096 zf-C2H2 83-105 aa PF22996 C2H2-2nd_BIRD-IDD 121-155 aa PF22995 C2CH-3rd_BIRD-IDD 159-183 aa PF22992 C2CH-4th_BIRD-IDD 186-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799744.1`	Pfam	`PF00096`	zf-C2H2	Domain	83	105	1.4e-07	32.3	Zinc finger, C2H2 type
`XP_057799744.1`	Pfam	`PF22996`	C2H2-2nd_BIRD-IDD	Family	121	155	7.1e-23	81.1	BIRD-IDD transcription factor, second C2H2 zinc finger
`XP_057799744.1`	Pfam	`PF22995`	C2CH-3rd_BIRD-IDD	Domain	159	183	5.5e-16	58.7	BIRD-IDD transcription factor, third C2HC zinc finger
`XP_057799744.1`	Pfam	`PF22992`	C2CH-4th_BIRD-IDD	Domain	186	223	1.7e-24	86.1	BIRD-IDD transcription factor, fourth C2HC zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943761.1
ATGCCTGTTGGCTTAATTGGTTTTGATTGGGATGAAGAAATAAGAGATACCTTCTCATCCACACCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTGTTTTCATCTTGTTGGTTTTAGCAGCAACAGGCGATGTTTTTATTGTAAAAGCTATAGGATTTTTGGAGCTCTAGGAAACTAAATTTCATAGGTTTGTGAAGAAGAAGAAGAAAGAGAGGCATGGATTTGCAGTGATGAAAGCTTTGCGTTGACCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015381
ATGTTACAAGGCATGGGAGTAGATGATTCTTTGTCGAATTTAACGTCGGCGATATCGAATGAAGCAAGCATCAATTCGAGCTCCAACGTTAATGAAATGGGTGGTGGAGGTACAATCCCACAGCAGCATATGTACAACCCATCACAGCCTCCACCTCCCAAGAAGAGAAGAAACCTACCTGGCAATCCAGATCCGGACGCCGAGGTGGTGGCGCTGTCGCCGCACGCGCTGATGGCGACGAACCGGTTCGTGTGCGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799744.1
MLQGMGVDDSLSNLTSAISNEASINSSSNVNEMGGGGTIPQQHMYNPSQPPPPKKRRNLPGNPDPDAEVVALSPHALMATNRFVCEICSKGFQRDQNLQLHRRGHNLPWKLKQRSSKEVVRKKVYVCPEPSCVHHDPARALGDLTGIKKHFFRKHGEKKWKCEKCSKRYAVQSDWKAHSKICGTREYRCDCGTLFSRRDSFITHRAFCDALAEESSRSMPQTAPINHAQIHAFTNPNFPNLKQETLNFTLPPWLSPNDPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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