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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004604`

染色体: Chr03 坐标: 63809935-63811270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004604`
名称	SmilChr03G004604
描述	uncharacterized SmilChr03G004604
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63809935 - 63811270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015389`
GeneID	`131015389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015389`
原始查询	`LOC131015389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821674]; symbol=AT3G21210; hit=AT3G21210; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821674]; symbol=AT3G21210; hit=AT3G21210; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G21210` (AT3G21210) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821674] identity=31; qcov=0.492; evalue=8.11e-20; confidence=low
Rice	`Os07g0611200` - identity=29.6; qcov=0.327; evalue=2.3e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799753.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057799753.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057799753.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799753.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799753.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63809945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr3:63810031`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	B109,B121,B129,B134,B18,B44,B58,B60,B64,B68,B73,B89,C15,C23,C47,C60,C61,C62,C71,D9
`Chr3:63810034`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	B109,B121,B129,B134,B18,B44,B58,B60,B64,B68,B73,B89,C15,C23,C47,C60,C61,C62,C71,D9
`Chr3:63810061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C16,C29,C69
`Chr3:63810099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:63810114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C80
`Chr3:63810116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr3:63810133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B134,B95
`Chr3:63810164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr3:63810172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:63810185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr3:63810228`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B108,C28,C43,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799753.1

413 aa

206

413

C1_2

PF03107 C1_2 167-214 aa PF03107 C1_2 225-270 aa PF03107 C1_2 284-332 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799753.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	167	214	1.2e-25	90.3	C1 domain
`XP_057799753.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	225	270	1.2e-25	90.3	C1 domain
`XP_057799753.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	284	332	1.2e-25	90.3	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943770.1
ATTTCATAATTGAGCTTATAAGAAAATTCTTATTAGAATGAGAAAATTGAAGATAAATTATTGCTTATAAAACTCAAGTAAGGGTGAGAAACTTATGAGTTGTTTTAAGGAACTTATAAGTTCAGTCAAACACCCCCTTAATCATCATCATAAATATTTGTTAATTAGTGTTTTTGTTGGTTGTAGAAGAAATGAGAAAGGGATTATGGAGTTCCCAATAAGTGATGTGGGTGAGGAGCTAATTGGAGGTTTGGTAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015389
ATGAGTTGTTTTAAGGAACTTATAAGTTCAGTCAAACACCCCCTTAATCATCATCATAAATATTTGTTAATTAGTGTTTTTGTTGGTTGTAGAAGAAATGAGAAAGGGATTATGGAGTTCCCAATAAGTGATGTGGGTGAGGAGCTAATTGGAGGTTTGGTAAAGAGAGAAGGAAGAGCTATATCAATACCTCATCATGATGAAGATTATAAGTTCCATAATCACAAACTCAGATTAGTGTCATCATCTCCGGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799753.1
MSCFKELISSVKHPLNHHHKYLLISVFVGCRRNEKGIMEFPISDVGEELIGGLVKREGRAISIPHHDEDYKFHNHKLRLVSSSPEEEEEEEENSSDDDDGKDQESQLICDGCITPIFNRKQRPSSSSSSSSSSKDYYYMSCSSGCNYNLHMACFHLPSRLPSIPLHHQSGHHLILKSCDELPSKEWECKVCSLDSSGLFYACTECNFIADIKCASLPATIYHTAHPQHPLHFQSGGGVVTYCDAMCGEITYIYGCYACGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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