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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004572`

染色体: Chr03 坐标: 63622764-63625818 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004572`
名称	SmilChr03G004572
描述	glycosyltransferase BC10-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63622764 - 63625818 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015400`
GeneID	`131015400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015400`
原始查询	`LOC131015400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase BC10-like
产物	glycosyltransferase BC10-like
Arabidopsis	`AT5G11730` (AT5G11730) Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831045] identity=66.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0731050` - identity=69.5; qcov=0.808; evalue=1.02e-165; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02485 (Branch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057799764.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057799764.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799764.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799764.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799764.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63623691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C82,C85
`Chr3:63623768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:63623825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C82
`Chr3:63623833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:63623855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:63623892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C26,C7
`Chr3:63623898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B65,C59,D10
`Chr3:63623909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr3:63623924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:63623972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:63623976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:63624035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B138,C22,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799764.1

386 aa

193

386

Branch

PF02485 Branch 118-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799764.1`	Pfam	`PF02485`	Branch	Family	118	341	1.9e-85	287.1	Core-2/I-Branching enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943781.1
TGTGATTGAGATTTACAGACATTCTTAAAAAACCAAAAAGAATTCACCACATGACGCGCCACGTTCCTCAATTTGCATCACTTTTCCATTAGATTTCACCACACCATTCTTGTGTGGCTCATCTCTCTCCTCTCTCTATCATCATTTTTAATCAATTTCTCACTGGATTTTGGGAGGAGTTGTTTGCTTTCTTAAATCTCTGGGAATTCCATTTCCGGTATTTTCGGTTGGGTTCGTTTTTGAATGCTTCGATTACTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015400
ATGCAATATAAGGTTGTACATATGGAAGAAGGCAAAGATCCCACTGCAGGGAGCAGGGTAGGTCAGACTAGGGTTTTGCCACAGAGGGTGCTTCAGCTGCTTGTACTTTTTCTGGTTCTGTGCTTTACTTTCTCTGTTGTTAGCATCTACATGATTAGATACTTTGGGATTAATAATGTGGTGACCTCGATCAAGCCTATATTAGTGCCCTGCAATCACGAACCGTTGGGTTTAGATCAATGGATCGAGCCCCCGTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799764.1
MQYKVVHMEEGKDPTAGSRVGQTRVLPQRVLQLLVLFLVLCFTFSVVSIYMIRYFGINNVVTSIKPILVPCNHEPLGLDQWIEPPSNLMHKMSDEELFWRATFVPRVSKYPFERVPKVAFMFLTKGPLPLAPLWERFFKGHEGKYSIYIHSLPTFEADFPSGSVFYKRQIPSQVSEWGRMSMCDAERRLLANALLDISNERFVLLSESCIPLHNFTTIYDYVIGSKYSFMGAFDDPGPYGRGRYNYNMLPEVNVSDWRKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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