当前解析结果
SmilChr03G004626| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004626 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004626 |
| 描述 | probable magnesium transporter NIPA9 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 63919830 - 63923389 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015412 |
|---|---|
| GeneID | 131015412 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015412 |
| 原始查询 | LOC131015412 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable magnesium transporter NIPA9 |
| 产物 | probable magnesium transporter NIPA9 |
| Arabidopsis | AT5G11960 (AT5G11960)magnesium transporter, putative (DUF803) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831069] identity=74; qcov=0.997; evalue=4.99e-180; confidence=high |
| Rice | Os01g0708300- identity=69.9; qcov=0.849; evalue=7.39e-146; confidence=high |
| GO | GO:0015095 (magnesium ion transmembrane transporter activity); GO:0015693 (magnesium ion transport); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015412 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Vacuole | 液泡 | 1.00000 | XP_057799778.1 |
| 2 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.80000 | XP_057799778.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057799778.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057799778.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799778.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:63920142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,B45 |
Chr3:63920217 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B32,D3 |
Chr3:63920247 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B56,B7,B96,C40 |
Chr3:63920261 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B26 |
Chr3:63920261 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr3:63920268 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr3:63920271 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:63920578 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
Chr3:63920635 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,B45 |
Chr3:63921059 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B32,D3 |
Chr3:63921077 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,C80 |
Chr3:63921784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。