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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004521`

染色体: Chr03 坐标: 63273797-63278049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004521`
名称	SmilChr03G004521
描述	probable transcriptional regulatory protein At2g25830
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63273797 - 63278049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015416`
GeneID	`131015416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015416`
原始查询	`LOC131015416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcriptional regulatory protein At2g25830
产物	probable transcriptional regulatory protein At2g25830
Arabidopsis	`AT2G25830` (AT2G25830) YebC-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817125] identity=61.4; qcov=1.04; evalue=6.26e-134; confidence=high
Rice	`Os05g0519800` - identity=64.8; qcov=0.839; evalue=2.61e-124; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF01709 (Transcrip_reg); PF20772 (TACO1_YebC_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799784.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057799784.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799784.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799784.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63274038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B71,C75
`Chr3:63274297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr3:63274356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B87,C49,C61
`Chr3:63274381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr3:63274810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B75
`Chr3:63274822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:63274861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:63275082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr3:63275100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C50,C58,C69
`Chr3:63277509`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B23,B27,B53,B71,C25,C42,C44,C55,C63,C73,C83
`Chr3:63277539`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B3,C39
`Chr3:63277539`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B3,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799784.1

322 aa

161

322

TACO1_YebC_N

Transcrip_reg

PF20772 TACO1_YebC_N 79-148 aa PF01709 Transcrip_reg 154-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799784.1`	Pfam	`PF20772`	TACO1_YebC_N	Domain	79	148	2.9e-19	70.0	TACO1/YebC protein N-terminal domain
`XP_057799784.1`	Pfam	`PF01709`	Transcrip_reg	Domain	154	320	4.4e-39	134.5	TACO1/YebC second and third domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943801.1
AACAAAAAATACTGTATTTATTAGAAAAGGGTATTCCTAATTTTAAGCAAAATGGGGAGTAGTGATGTAGGAAGAAAGAAACATTAAAGCAAACAAATTAGAAAAGAAAAAAGGGGAAAAATCATGGTTTTCTAGGGATTTGATTTTGCAGGATAAGAATTTTTTCACAAGGATGAAAAATTTCTCGCCTTGATTCAATCCAAAACGTAGAAAAATGTCGTCTTCAGCAGCAATCAGAGGTTTTGGTTCATTACTCACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015416
ATGTCGTCTTCAGCAGCAATCAGAGGTTTTGGTTCATTACTCACCAGATTTTCAAATGGGGTTTCTCTTAAACCCCCAAGCTCTCTCTCTCCTCCCAGAACTGGTTATTCGATAAGAAATTTGTCTTCATTTTCTAGGTATTCGTGTTTGGGAGATTGGGCTTCGTTTTCTCAGCTTAATCATGGAAGCTCTGAGAGGAAGATTTCAACTCGCGCGCCGCTGTGTATGGGCAGACGATCGAGTAAAATTGCCGGCAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799784.1
MSSSAAIRGFGSLLTRFSNGVSLKPPSSLSPPRTGYSIRNLSSFSRYSCLGDWASFSQLNHGSSERKISTRAPLCMGRRSSKIAGRKTSNDLKKGKLYARFGKEVVSAVKKGGSSPVSNTALAALFEKAKELDIPRDILDRNIKRASEKGQESYIEKFYEVYGYGGVGMIVQVLTDKVNRSVAAIREVAKDCGGKMADSGSIMFKFRRARVVTVKASDVDKDELLIIALDAGAEDVIEPWMDEDNTEEDSERRYKIVSSM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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