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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004596`

染色体: Chr03 坐标: 63776620-63778140 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004596`
名称	SmilChr03G004596
描述	LOB domain-containing protein 7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63776620 - 63778140 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015423`
GeneID	`131015423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015423`
原始查询	`LOC131015423`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 7-like
产物	LOB domain-containing protein 7-like
Arabidopsis	`AT5G63090` (LOB) Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836429] identity=42.6; qcov=0.334; evalue=5.75e-23; confidence=low
Rice	`Os08g0402100` - identity=27.5; qcov=0.831; evalue=1.57e-23; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057799793.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799793.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799793.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799793.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63777236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B4,B43,B99,C78
`Chr3:63777268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B44,B78,B93,C8
`Chr3:63777765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C79
`Chr3:63777794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:63777806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:63777809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B60,C23,C42,C62
`Chr3:63777834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C40
`Chr3:63777865`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B124
`Chr3:63777865`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B124
`Chr3:63777926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:63777953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:63777967`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799793.1

302 aa

151

302

LOB

PF03195 LOB 19-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799793.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	19	116	1.8e-28	99.7	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098499.1
TCCGATTTTCAATCCAAAAAAAGTAAAAAAAACCAAACTAAATTAACAAGATGAGCTCCCCCCCGTCGCTGCCCCCACTACCCCCCGGCCGCCGCCGCAAACGGTCCTGCGCCGCCTGCTGGCTCATGCACCTCCCATGCCCCGACGGCTGCCTCCTCGCTCCCTACTTCCCCGCCGAGCGCGCCGCCGACTACGTAAACGTCCACCGCCTCTTCGGCCGCCAAAAAGTCATCAACATCCTCAACGCGGTGAAGCCGCAC...

XM_057943810.1
TCCGATTTTCAATCCAAAAAAAGTAAAAAAAACCAAACTAAATTAACAAGATGAGCTCCCCCCCGTCGCTGCCCCCACTACCCCCCGGCCGCCGCCGCAAACGGTCCTGCGCCGCCTGCTGGCTCATGCACCTCCCATGCCCCGACGGCTGCCTCCTCGCTCCCTACTTCCCCGCCGAGCGCGCCGCCGACTACGTAAACGTCCACCGCCTCTTCGGCCGCCAAAAAGTCATCAACATCCTCAACGCGGTGAAGCCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015423
ATGAGCTCCCCCCCGTCGCTGCCCCCACTACCCCCCGGCCGCCGCCGCAAACGGTCCTGCGCCGCCTGCTGGCTCATGCACCTCCCATGCCCCGACGGCTGCCTCCTCGCTCCCTACTTCCCCGCCGAGCGCGCCGCCGACTACGTAAACGTCCACCGCCTCTTCGGCCGCCAAAAAGTCATCAACATCCTCAACGCGGTGAAGCCGCACCTCCGCGACGACGCCATCACGTCCATCACCTACGAGGCCAACTTCCGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799793.1
MSSPPSLPPLPPGRRRKRSCAACWLMHLPCPDGCLLAPYFPAERAADYVNVHRLFGRQKVINILNAVKPHLRDDAITSITYEANFRAAHPVGGCTAAVCTLVAQINYLTAQLDAVRQHIARCIEPMQNLDQNLNQYPRFLNLDQQIPEDAPQFFNAGDNQINNPIVLNGDHQQIEEDDQQQFFNAGDNQINNPIVLNGDHQQIEEDDQQQFFNGGDNQMNPIVLNGDHQQIEEDDQQQFFNGGDNQMNPIVLNGDHQQIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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