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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004545`

染色体: Chr03 坐标: 63444953-63447788 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004545`
名称	SmilChr03G004545
描述	protein REGULATOR OF FATTY ACID COMPOSITION 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63444953 - 63447788 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015425`
GeneID	`131015425`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015425`
原始查询	`LOC131015425`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein REGULATOR OF FATTY ACID COMPOSITION 3, chloroplastic
产物	protein REGULATOR OF FATTY ACID COMPOSITION 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G17170` (RFC3) Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820974] identity=69; qcov=0.58; evalue=5.58e-89; confidence=medium
Rice	`Os12g0563200` (TCD11) - identity=58.7; qcov=0.75; evalue=1.67e-84; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01250 (Ribosomal_S6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015425

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057799802.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057799802.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799802.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799802.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799802.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63445202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:63445225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B6
`Chr3:63445259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B86,C26
`Chr3:63445282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B79
`Chr3:63445605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B89,C49,C61,C84
`Chr3:63445618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B79
`Chr3:63446086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B85,D1
`Chr3:63446898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B30
`Chr3:63447289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C40
`Chr3:63447375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C1
`Chr3:63447412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,C12,C24,C77,C86
`Chr3:63447460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799802.1

300 aa

150

300

Ribosomal_S6

PF01250 Ribosomal_S6 133-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799802.1`	Pfam	`PF01250`	Ribosomal_S6	Domain	133	221	1.4e-26	93.2	Ribosomal protein S6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943819.1
ATATTAACTCATTTCATAACTTAACCCATAAAAAACAATATCAAGAAATTTTGCTCCTCCTCTTCCAATACCTTCAATATCTTTACGGAATTACCAAAAACACGCTTCTCTCCTTCCTAAATCACAGCTTCTTCTCTTATCTACAGCTCCAAGAAACATAATAATGGCTTCCATCGCGCTAAAATCTACTCAATTGGGCATCAACTGCATCCCAAATTCGAACATCAATCGATGCAAAAGCGCTAATTTCTCTTCATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015425
ATGGCTTCCATCGCGCTAAAATCTACTCAATTGGGCATCAACTGCATCCCAAATTCGAACATCAATCGATGCAAAAGCGCTAATTTCTCTTCATCATTTTCCTGCTCGTCGCAGTTGTTTTCGCCAAAATTAAAGCTCAGAAGCAACTCGACAGTAACGGCGGCAGCGAAGAAGGAAAATAAACCCAAGAAAAAGAGAAAAGAAGATAGCCATAGCTTCATCTCCAGGCCCGATGAAGCCACTGGCCCTTTTCCCGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799802.1
MASIALKSTQLGINCIPNSNINRCKSANFSSSFSCSSQLFSPKLKLRSNSTVTAAAKKENKPKKKRKEDSHSFISRPDEATGPFPEAVLLKQRNVEEDDGRLMPEFADVEERELFEALNLLLESDTDVDQRRHYEVVYLIHEDHKDEVENVNTKVQEFLKEKKGKIWRFSDWGMRRLAYKIKKAKNAHYILMNFEVEARWINDFKSLLDKDERVIRHLVMKRDKAETDDCPPPPEFGTLRADMVDDDDDDDIDDEEEEEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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