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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004579`

染色体: Chr03 坐标: 63668918-63671346 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004579`
名称	SmilChr03G004579
描述	uncharacterized SmilChr03G004579
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63668918 - 63671346 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015449`
GeneID	`131015449`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015449`
原始查询	`LOC131015449`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PITH domain protein (DUF1000) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817136]; symbol=AT2G25950; hit=AT2G25950; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PITH domain protein (DUF1000) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817136]; symbol=AT2G25950; hit=AT2G25950; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G25950` (AT2G25950) PITH domain protein (DUF1000) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817136] identity=84.3; qcov=1; evalue=1.24e-132; confidence=high
Rice	`Os01g0559000` (B1144D11.37-1) - identity=82.3; qcov=1; evalue=3.75e-131; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06201 (PITH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015449

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799845.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799845.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799845.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799845.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799845.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63669436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr3:63669451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B53
`Chr3:63669452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C17
`Chr3:63669455`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A14,A15,B105,B11,B130,B133,B140,B15,B20,B27,B29,B3,B44,B6,B68,B71,B76,B80,B94,C40,C44,C49,C51,C7,C75,C76,C84,D10
`Chr3:63669458`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A14,A15,B105,B11,B130,B133,B140,B15,B20,B27,B29,B3,B44,B6,B68,B71,B76,B80,B94,C40,C44,C49,C51,C7,C75,C76,C84,D10
`Chr3:63669468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C10
`Chr3:63669468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:63669471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C17
`Chr3:63669867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B42,B43,C84
`Chr3:63670168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,C1,C27,C59
`Chr3:63670387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B44
`Chr3:63670733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799845.1

204 aa

102

204

PITH

PF06201 PITH 12-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799845.1`	Pfam	`PF06201`	PITH	Domain	12	184	3.9e-55	186.9	PITH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943862.1
AAACTAAACTGGTGGAACAATTTAAAAGCCAAAACCCGTCGGCGCAAAAATCTAATTTTCACGCACAAAAAAACACACACAACACGCACTCAGACTGCAACCGAGCTGGGGAAAAAATGGCGTGTTTGCACGATCACAGCTGCGAAGAGCACGATTGCTCCACCGATTGGTCTCTCTACAAGCACATCGATCTCTCCAAGGTATCTGCGTTGAATGAGGCTGTTTCTGGAAGTGTGAAGTCGGTGTTCAAAGCTTGGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015449
ATGGCGTGTTTGCACGATCACAGCTGCGAAGAGCACGATTGCTCCACCGATTGGTCTCTCTACAAGCACATCGATCTCTCCAAGGTATCTGCGTTGAATGAGGCTGTTTCTGGAAGTGTGAAGTCGGTGTTCAAAGCTTGGGAGCAGCGTCTTAACTCTTCAGAGGGTCACTTGGAAAGCAACGAAGGAGATCCCGAGTTGATAGTCTTTATTCCATTTACCTCAGATGTTAAGCTAAAGAGCATTTCAATTGTTGGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799845.1
MACLHDHSCEEHDCSTDWSLYKHIDLSKVSALNEAVSGSVKSVFKAWEQRLNSSEGHLESNEGDPELIVFIPFTSDVKLKSISIVGGGDGTSPVKMRAFINREGIDFSDAQNMQAVQEWELAENLQGVLEYQTRYSRFQSVGNLTLHFPDNFGGDTTQIHYIGLKGEATQLKRDVVATIVYEITPNPSDHKTRADTGGGLSHVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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