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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004512`

染色体: Chr03 坐标: 63189498-63192183 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004512`
名称	SmilChr03G004512
描述	nicastrin-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63189498 - 63192183 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015465`
GeneID	`131015465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015465`
原始查询	`LOC131015465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nicastrin-like
产物	nicastrin-like
Arabidopsis	`AT3G52640` (AT3G52640) Zn-dependent exopeptidases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824430] identity=57.3; qcov=0.966; evalue=4.63e-56; confidence=high
Rice	`Os02g0736500` - identity=53.1; qcov=0.966; evalue=3.47e-45; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016485 (protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF18266 (Ncstrn_small)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057799868.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057799868.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799868.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799868.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799868.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63189866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A1,A11,A2,B1,B140,B2,B74,C47
`Chr3:63189890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C25,C34,C67
`Chr3:63189893`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	B101,B108,B110,B111,B131,B21,B35,B39,B56,B64,B65,B73,B76,B9,B96,C16,C17,C19,C20,C23,C4,C41,C45,C49,C53,C6,C62,C8
`Chr3:63189907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr3:63191023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C28
`Chr3:63191597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B68
`Chr3:63191723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B22,C28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799868.1

148 aa

148

Ncstrn_small

PF18266 Ncstrn_small 9-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799868.1`	Pfam	`PF18266`	Ncstrn_small	Domain	9	141	1.2e-37	130.2	Nicastrin small lobe

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943885.1
TACCAGGAATCTGAAGTTTCTACATTAAGTTATTAATAGCTGCATGTAATGCTCTTTAATGTCCAAATGGCTATTTTTCTGTTCATTTGAGTATAAATCTGCAATTATTCAGACCCATACAGTTTCTTCCCTTTCCCTAAAATAAATATTTATTCATTAATAAGACCAATATCTTGTTGTAATATGGTGGGATTGTTTATACTTCAAGTGGAGAAGTACTCCATGTATAATAGCATTGCAAATTGGGTCAAGACTTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015465
ATGTACACAGAAATTGATGGATTTCCTTGTGTCCGTCTACTCAACCTTTCAGGGGAAATTGGTTGCTCAAATCCTGCACGTGAGAAAGTTGTCGCACCAATTGTTAGATTTAAGAATTCAAAGGAGTTGACTGGACCAGCAGCAGTCCTGGTCTCTTTAGATGAATTTGAAAGCGTGCTGTCAAGAGTATCAAAAGACTTAGATTTTGCTAGTAAAGTGGCCGGCATATTTGTTGAATCAAGAAGTCAGGTTCAAAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799868.1
MYTEIDGFPCVRLLNLSGEIGCSNPAREKVVAPIVRFKNSKELTGPAAVLVSLDEFESVLSRVSKDLDFASKVAGIFVESRSQVQNGLKGFSPDVKFPQAEFAPYTSNNFQWNPAGSGIIWKAYNFPVILLSETSTSILQQVFGIQNI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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