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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004547`

染色体: Chr03 坐标: 63451207-63453469 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004547`
名称	SmilChr03G004547
描述	signal recognition particle 19 kDa protein
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	63451207 - 63453469 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015469`
GeneID	`131015469`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015469`
原始查询	`LOC131015469`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal recognition particle 19 kDa protein
产物	signal recognition particle 19 kDa protein
Arabidopsis	`AT1G48160` (AT1G48160) signal recognition particle 19 kDa protein, putative / SRP19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841235] identity=67.6; qcov=0.822; evalue=1.11e-54; confidence=high
Rice	`Os06g0342100` (SRP19) - identity=66.4; qcov=0.881; evalue=4.51e-57; confidence=high
GO	GO:0005786 (signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting); GO:0006614 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane); GO:0006617 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, signal sequence recognition); GO:0008312 (7S RNA binding)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01922 (SRP19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015469

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057799875.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057799875.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057799875.1`
4	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057799875.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057799875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:63451960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:63451967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B28
`Chr3:63453135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B86,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799875.1

135 aa

135

SRP19

PF01922 SRP19 14-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799875.1`	Pfam	`PF01922`	SRP19	Family	14	107	6.8e-33	114.1	SRP19 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943892.1
TGAAGCTATTAAGAAAAGGATTTCAATCTGATCCAAATTTTAGGCCCAACATCGCAAACGACTACCACTTCTCTCTCTACGAACTTCTCACTCCACCACCGGCGTTCCTCTCCAGATTTCTCAAAAACCCACGAAGCGCCGCCGCCTGAGGACTAAATCATGGATGTCGATATGCAGAATATCAAAAAATGGGTGATCTTTTACCCAATTTATATAAATTCGAAGAAAACCCTAGCCGAGGGACGGAGAATCAATGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015469
ATGGATGTCGATATGCAGAATATCAAAAAATGGGTGATCTTTTACCCAATTTATATAAATTCGAAGAAAACCCTAGCCGAGGGACGGAGAATCAATGCAAGCAAAGCATGTGAAAACCCTACGTGCACGGAGGTTTACGATTGCATTGCTCACCTGAAAATCCCTTGTGTGATTGAGAGTGAGAAGGCATACCCTCGGGATTTTATGCAAAGAGGTAGAGTGAGAGTGATGTTGAAAAAGGAAGATGGGAGCTTCTACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799875.1
MDVDMQNIKKWVIFYPIYINSKKTLAEGRRINASKACENPTCTEVYDCIAHLKIPCVIESEKAYPRDFMQRGRVRVMLKKEDGSFYNPAISSRKQLMLHVAELVPRHPGRTKKQEAATSAAAGSSKSGKGGKKKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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