当前解析结果
SmilChr03G004603| 统一新 Gene ID | SmilChr03G004603 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G004603 |
| 描述 | UDP-sulfoquinovose synthase, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 63807370 - 63815364 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015472 |
|---|---|
| GeneID | 131015472 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015472 |
| 原始查询 | LOC131015472 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-sulfoquinovose synthase, chloroplastic-like |
| 产物 | UDP-sulfoquinovose synthase%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT4G33030 (SQD1)sulfoquinovosyldiacylglycerol 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829440] identity=53.4; qcov=0.584; evalue=2.27e-17; confidence=low |
| Rice | Os05g0387200- identity=62.7; qcov=0.536; evalue=4.02e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015472 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057799878.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.60000 | XP_057799878.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057799878.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799878.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799878.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:63814919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr3:63814935 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B120,B65,C13,C61 |
Chr3:63814986 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C54 |
Chr3:63814991 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B135,B21,B56,B72,B97 |
Chr3:63815011 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B41,C19,C2 |
Chr3:63815123 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B72 |
Chr3:63815178 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B56 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。