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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004641`

染色体: Chr03 坐标: 64000920-64004225 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004641`
名称	SmilChr03G004641
描述	uncharacterized protein At4g33100
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64000920 - 64004225 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015478`
GeneID	`131015478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015478`
原始查询	`LOC131015478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829447]; symbol=AT4G33100; hit=AT4G33100; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	protein phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829447]; symbol=AT4G33100; hit=AT4G33100; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G33100` (AT4G33100) protein phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829447] identity=62.6; qcov=0.892; evalue=9.87e-36; confidence=medium
Rice	`Os09g0361700` - identity=51.3; qcov=0.839; evalue=2.09e-23; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05254 (UPF0203)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057799885.1`
2	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	1.00000	`XP_057799885.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799885.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799885.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799885.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64001338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C31,C4,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799885.1

93 aa

UPF0203

PF05254 UPF0203 12-73 aa

XP_057799886.1

93 aa

UPF0203

PF05254 UPF0203 12-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799885.1`	Pfam	`PF05254`	UPF0203	Family	12	73	3.9e-23	82.2	Uncharacterised protein family (UPF0203)
`XP_057799886.1`	Pfam	`PF05254`	UPF0203	Family	12	73	3.9e-23	82.2	Uncharacterised protein family (UPF0203)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943903.1
TTCTGATATAATAGCCTTTAAATCAACTTCGGCCCAATATTTACTTGGCCGCAAAGAAAATTGCAGGAAAGTATAATTTATTATTGGAAAATAGATTAACCAATTTTGTACGAATTTTTGTTTACCAGTTCAAAGATGTTGATTTCATAAAATTGTAATCTTAGAAAATGGGGATTATGAGAGACAGTAAGCGCTCCTCTTCTTCAGCAACTTCACCTTGTGCCCATTTGAGAACTGCGTATCACAATTGCTTCAACCGA...

XM_057943902.1
TAATAGCCTTTAAATCAACTTCGGCCCAATATTTACTTGGCCGCAAAGAAAATTGCAGGAAAGTATAATTTATTATTGGAAAATAGATTAACCAATTTTGTACGAATTTTTGTTTACCAGTTCAAAGATGTTGATTTCATAAAATTGTAATCTTAGAAAATGGGGATTATGAGAGACAGTAAGCGCTCCTCTTCTTCAGCAACTTCACCTTGTGCCCATTTGAGAACTGCGTATCACAATTGCTTCAACCGATGGTATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015478
ATGGGGATTATGAGAGACAGTAAGCGCTCCTCTTCTTCAGCAACTTCACCTTGTGCCCATTTGAGAACTGCGTATCACAATTGCTTCAACCGATGGTATTCGGAGAAATTCCTGAAAGGGCAATGGGATAAAGAAGGGTGCATTTCTGAGTGGGAGAAATACAGACAGTGTTTATCTCAACATTTGGATGACAAGCATCTAAGTAGGTTCTTGGAAGCTGATGGGGTGTTGGGTTTGACTGATCAAGATGAATTCAAGAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799885.1
MGIMRDSKRSSSSATSPCAHLRTAYHNCFNRWYSEKFLKGQWDKEGCISEWEKYRQCLSQHLDDKHLSRFLEADGVLGLTDQDEFKSKTGVSQ

XP_057799886.1
MGIMRDSKRSSSSATSPCAHLRTAYHNCFNRWYSEKFLKGQWDKEGCISEWEKYRQCLSQHLDDKHLSRFLEADGVLGLTDQDEFKSKTGVSQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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