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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004669`

染色体: Chr03 坐标: 64156790-64163442 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004669`
名称	SmilChr03G004669
描述	F-box/LRR-repeat protein 15-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64156790 - 64163442 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015507`
GeneID	`131015507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015507`
原始查询	`LOC131015507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein 15-like
产物	F-box/LRR-repeat protein 15-like
Arabidopsis	`AT4G33210` (SLOMO) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829457] identity=72.1; qcov=0.788; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0396400` (OsFbox552) - identity=63.3; qcov=0.642; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799893.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799893.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799893.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799893.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64157491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:64157502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A22,B74,C86,D8
`Chr3:64157671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C78
`Chr3:64157753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:64158113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:64158173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:64158443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B32,B69,C53,C78
`Chr3:64160160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B82
`Chr3:64160179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr3:64160329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B135,C23,D9
`Chr3:64160704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B13,B134,B58
`Chr3:64161204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B32,B69,C53,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799893.1

1019 aa

510

1019

F-box

F-box-like

PF00646 F-box 221-260 aa PF12937 F-box-like 224-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799893.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	221	260	2.2e-10	40.7	F-box domain
`XP_057799893.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	224	264	2.7e-12	46.9	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943910.1
AAAAGACCGAAAACTTCGTTCAAGTCCCAATTTCTATTCTAATTTCTAACAAAAGATAAAGCCTTTACCGCTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGTAATCGCCAAAGAGGAAAACAATAATCTCCATTGCCGCCGATCTTTCTCGAAGAAGAAATTCCGAAGAAGAGAGTTTCTTCACTGCGCTCGTTTCTTCCGATCCGATCTGTTTTGTCCCGTGAACGGAGTTTTTTTCCACAAATACATTCGCTTGTGGTTTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015507
ATGAGGATTTGCTGCTTTGCATTTTTATGCTTTGGAGAGAAAGAGGAGGACAGTGTTGCTACGTGTAATTTATGTTATTTTTATTGTCGGAATAAGGAGGGCAGCTATATGAGGGAGAGCCTTTTGGGAAATGCGATCGAGGATATGGATGATAATGATTCTGAATTAGGGTTTTGGGCTAACTTTCACAATGGTGGTGGTAGTGGTAGTGGTTTAGGTCTACGGGTGGATGGCGAGCGAGCTGACGAGGAGGAAACAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799893.1
MRICCFAFLCFGEKEEDSVATCNLCYFYCRNKEGSYMRESLLGNAIEDMDDNDSELGFWANFHNGGGSGSGLGLRVDGERADEEETNEMFDLDGESSKKSEDFLLWLNDVKTRGAADGASGSQELKVDVNLNLGLGGEPSSSTAMVATGRDSSDRDSQNKRPKVHSFSLDWGTQFENEFHYLRPHHDKFDDGDLPDSTIGGDDATNNIDANKMDNMEVRMDLTDDLLHMVFSFLEHIDLCRAARVCRQWRDASSHEDFWR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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