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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004676`

染色体: Chr03 坐标: 64206822-64208568 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004676`
名称	SmilChr03G004676
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3 LIKE 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64206822 - 64208568 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015514`
GeneID	`131015514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015514`
原始查询	`LOC131015514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OXIDATIVE STRESS 3 LIKE 1
产物	protein OXIDATIVE STRESS 3 LIKE 1
Arabidopsis	`AT5G21940` (AT5G21940) hybrid signal transduction histidine kinase M-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832254] identity=52.6; qcov=0.582; evalue=5.08e-28; confidence=medium
Rice	`Os02g0778700` - identity=39.5; qcov=0.578; evalue=1.67e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30470 (OXS3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799901.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799901.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799901.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799901.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057799901.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64206968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:64207029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B15,B45,C5,C7
`Chr3:64207066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:64207073`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B63,C71
`Chr3:64207073`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B63,C71
`Chr3:64207091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B89,B95
`Chr3:64207259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B140,C20,C8
`Chr3:64207897`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A16,A19,A21,B1,B101,B104,B110,B111,B119,B124,B126,B128,B138,B14,B16,B22,B23,B24,B36,B42,B43,B45,B47,B61,B7,B78,B79,B83,B89,B90,B92,B99,C15,C17,C18,C19,C32,C34,C37,C44,C48,C56,C59,C61,C68,C78,C8,C81,C82
`Chr3:64207922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799901.1

232 aa

116

232

OXS3

PF30470 OXS3 57-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799901.1`	Pfam	`PF30470`	OXS3	Family	57	223	2.4e-56	191.3	Oxidative stress 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943918.1
ATTGCTACCTTAATTTAATAAAATAAACTCTTTCCTTTTTTTCATTTTCTATTTTCTTCTCCCTCTAAAATAGAATCACTAGTGGATGAGGATTTCAGGATAAGACCTAACCATCCACCTCCCACCCCCACCCCACCCCCCCAACACCCCACCCCTCCACCAATTTTATCTCATCATTTATTATATATCCATCCAACAAAGAATATTCAACACTCAAATCCCTTTTTTCTTAAACTTCTCTCTCTCGTTAAGATCCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015514
ATGCCGACGAGAGTGATGAACAAAGATGGTGGGTTTGTTCATGGGATTAGTGAGATTTACGGTGGAGATCAGAGGTTCCTTGTGGAGAAAAAGGTTATGTTTAAGGATGTTAGAGAGGGACACAAAGAAGAAGAAGAAGAGGAAAGTGGGAAAATTGGGTTGTTGAAGAATAATTCTTGCAAGAATATTAGTTGCTCAGATGAATCATCATCTTCTATAGGGAAAAACAGTGATCTCTCTGAGAATTCGTTGGAGAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799901.1
MPTRVMNKDGGFVHGISEIYGGDQRFLVEKKVMFKDVREGHKEEEEEESGKIGLLKNNSCKNISCSDESSSSIGKNSDLSENSLEKSGDGEEVQSSYKGPLNAMKALEEVLPIRRGISRFYNGKSKSFASLGEASSSSSIKEIAKPENAYMRKRRNLLASNLVLEKTRGSPLRGNGGGISKSSAASRTTLALAVAMSNSESQCNSPGGSSSPRNGVAISNSNPNGMALKPSG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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