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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002332`

染色体: Chr01 坐标: 40470286-40471841 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002332`
名称	SmilChr01G002332
描述	gibberellin 20 oxidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40470286 - 40471841 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015520`
GeneID	`131015520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015520`
原始查询	`LOC131015520`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gibberellin 20 oxidase 1-like
产物	gibberellin 20 oxidase 1-like
Arabidopsis	`AT4G25420` (GA20OX1) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828645] identity=37.7; qcov=0.888; evalue=3.28e-63; confidence=medium
Rice	`Os03g0618300` - identity=35.3; qcov=0.907; evalue=8.65e-56; confidence=medium
GO	GO:0009416 (response to light stimulus); GO:0009686 (gibberellin biosynthetic process); GO:0009826 (unidimensional cell growth); GO:0009908 (flower development); GO:0045544 (gibberellin 20-oxidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799912.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799912.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799912.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799912.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799912.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40470467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B22,B41,C65
`Chr1:40470483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A7,C35
`Chr1:40470579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B121,B13,B2
`Chr1:40470632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B66,C48,D11
`Chr1:40470657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,C34,D9
`Chr1:40470761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:40471168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B123,B83,C53,C59
`Chr1:40471249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799912.1

356 aa

178

356

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 47-143 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 204-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799912.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	47	143	1.4e-17	65.2	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057799912.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	204	303	5e-33	114.1	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943929.1
CTTTTAGATTCTATATTTCAATAAATCCAGCCGCTATGGATAAATTATGAATCCGCATTGTACTATAGTTGTACAGTAGGGATGAGTTCTACCTGATCCTGTTCCCCTCTCTATATATAAGATACACAAGAGAATAAATCAAAATAATTAATTAGTTATCATCAATGGCAACACATGTTGACGAAGAACACCACGTAGAATCACTCTCTTCATCCGATCAGAAGCTACAAGTGAAAGACTTTGTGTGGTCGGCCGAGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015520
ATGGCAACACATGTTGACGAAGAACACCACGTAGAATCACTCTCTTCATCCGATCAGAAGCTACAAGTGAAAGACTTTGTGTGGTCGGCCGAGGAATGGCCGAAACTGAAGCACGATGTCTTCGACGACGAACAAGACATCCCTGTGATAAGACTTAGCCGGGAAGGCGAAGAAGACTACGGCGGCCTCTGCCGGAAAATGGTGGCAGCTGCTCAGAAATGGGGATTCTTCAAGCTGGTAGATCATGGCGTGGCTGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799912.1
MATHVDEEHHVESLSSSDQKLQVKDFVWSAEEWPKLKHDVFDDEQDIPVIRLSREGEEDYGGLCRKMVAAAQKWGFFKLVDHGVAAEIINDITVCLNRFYDLPMEQKLKGARTGSLPLGYSASNVDYGNNLPWAEILQLLHSPQQVLEFATRVYGDHSHHHFSNAMMKYLNAMEEVGIRILEMLATGLGLGSDFFSRHLREQENSMIRVNRYPPCPLPGRCLGLGSHSDPHTLTILLQDQVGGLQVCDHHNRWFGVRPLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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